Determinación de genes patogénicos Stx1 y STp presentes en Escherichia coli uropatógena aisladas de pacientes en Bucaramanga, Santander
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Resumen en ingles
The urinary tract infections (UTI) are a colonization of the bladder tracts, due to a microorganism that causes an inflammatory response. It also produces bacteriuria along with piuria, which are the main bacterial pathogen associated to Escherichia coli infections. It holds virulence genes such as Stx1 that produces uremic syndrome, and STp that yields a thermostable toxin. Aiming identify the pathogenic genes Stx1 and STp within Escherichia coli Uropathogenic by molecular techniques. A cross-sectional descriptive study, in which 250 suspicious strains samples of E. coli were gathered. These samples came from a third tier clinical laboratory; they were isolated from urine and delivered in agar chromo IDTM. Phenotypic identification was held as well as molecular identification of the phylogenetic groups according to Clermont, et al. (2000). The presence of genes was determined by a C-reactive-protein (CRP) duplex scheme that tracks Stx1 and STp. genes. Afterwards, samples were displayed and enlarged in a 2,0% agarose gel electrophoresis, and the presence of the genes in the marked strains was analyzed. Out of 250 samples, 214 of them were identified as E. coli, and the remaining were classified E. fergusonii, based on the phylogenetic group. 53% of the samples were strains categorized as viral and the other 43% were not viral at all. In terms of genes presence, 2% of the samples contained both genes, 4% had the STp gen only and 38% had the Stx1. At last it was found that in urinary tract infections there was a great presence of non-pathogenic strains since they are generally not expected to be present in this type of infections, also having a large percentage of the presence of the genes STX1 and STp codified in their genome.
Resumen en español
Las infecciones del tracto urinario (ITU), son la colonización de las vías urinarias del hospedero, por parte de un microorganismo, generando una respuesta inflamatoria, que produce, además, bacteriuria acompañada de piuria, siendo el principal patógeno de origen bacteriano relacionado con estas infecciones Escherichia coli, posee genes de virulencia como Stx1 produciendo síndrome urémico y STp produciendo una toxina termoestable. Teniendo por objetivo, Identificar los genes patogénicos Stx1 y STp presentes en Escherichia coli Uropatógena por técnicas moleculares. Se recolectaron 250 muestras de cepas sospechosas de E. coli, aisladas de orina, procedentes de un laboratorio clínico de tercer nivel, entregadas en agar chromo IDTM. Se realizó identificaron fenotípica y se hizo identificación molecular de los grupos filogenéticos según Clermont, et al. (2000), se realizó la determinación de la presencia de genes por medio de una PCR dúplex para detectar los genes Stx1, y STp. Posteriormente, se visualizaron los productos amplificados por electroforesis en gel de agarosa al 2,0%. Posteriormente se analizó la presencia de los genes en las cepas caracterizadas. De las 250 muestras, 214 muestras fueron identificadas como E. coli, el resto eran E. fergusonii, basado en el grupo filogenético, el 53% dieron cepas clasificadas como virulentas y el 47% clasificadas como no virulentas, en la presencia de los genes el 2% dio la presencia de ambos genes, el 4% la presencia del gen STp y el 38% la presencia del gen Stx1. Finalmente se encontró que en las infecciones urinarias se vio una gran presencia de las cepas no patógenas ya que generalmente no se espera que estén presente en este tipo de infecciones, teniendo además un gran porcentaje de la presencia de los genes Stx1 y STp codificados en su genoma.