Examinando por Autor "Carrillo Hernández, Marlen Yelitza"

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    Co-circulation and simultaneous co-infection of dengue, chikungunya, and zika viruses in patients with febrile syndrome at the Colombian-Venezuelan border
    (2018-01-30) Carrillo Hernández, Marlen Yelitza; Gómez Rangel, Sergio-Yebrail; Ruiz Saenz, Julian; Jaimes Villamizar, Lucy; Martínez Gutiérrez, Marlen
    Background: In Colombia, the dengue virus (DENV) has been endemic for decades, and with the recent entry of the chikungunya virus (CHIKV) (2014) and the Zika virus (ZIKV) (2015), health systems are overloaded because the diagnosis of these three diseases is based on clinical symptoms, and the three diseases share a symptomatology of febrile syndrome. Thus, the objective of this study was to use molecular methods to identify their co-circulation as well as the prevalence of co-infections, in a cohort of patients at the Colombian-Venezuelan border. Methods: A total of 157 serum samples from patients with febrile syndrome consistent with DENV were collected after informed consent and processed for the identification of DENV (conventional PCR and real-time PCR), CHIKV (conventional PCR), and ZIKV (real-time PCR). DENV-positive samples were serotyped, and some of those positive for DENV and CHIKV were sequenced. Results: Eighty-two patients were positive for one or more viruses: 33 (21.02%) for DENV, 47 (29.94%) for CHIKV, and 29 (18.47%) for ZIKV. The mean age range of the infected population was statistically higher in the patients infected with ZIKV (29.72 years) than in those infected with DENV or CHIKV (21.09 years). Both co-circulation and coinfection of these three viruses was found. The prevalence of DENV/CHIKV, DENV/ZIKV, and CHIKV/ZIKV co-infection was 7.64%, 6.37%, and 5.10%, with attack rates of 14.90, 12.42, and 9.93 cases per 100,000 inhabitants, respectively. Furthermore, three patients were found to be co-infected with all three viruses (prevalence of 1.91%), with an attack rate of 4.96 cases per 100,000 inhabitants. Conclusion: Our results demonstrate the simultaneous co-circulation of DENV, CHIKV, ZIKV and their co-infections at the Colombian-Venezuelan border. Moreover, it is necessary to improve the differential diagnosis in patients with acute febrile syndrome and to study the possible consequences of this epidemiological overview of the clinical outcomes of these diseases in endemic regions.
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    Comparación de la PCR anidada y PCR convencional en el diagnóstico de Plasmodium Vivax y P. Falciparum
    (2013) Galvis Serrano, Nestor Fabián; Carrillo Hernández, Marlen Yelitza; Quintero, Fabián A.
    Malaria is diseases caused by Plasmodium sp., and in Colombia approximately 160,000 cases are annually registered, where 75% are produced by P. vivax and 24% for P. falciparum. The molecular diagnosis is performed by Nested PCR, is a general amplification followed by a specific, using two pairs of different primers. This study compared the sensitivity and specificity of nested PCR with the conventional PCR to identify P. vivax and P. falciparum in DNA from blood of patients. As samples were selected 18 patients were identified as positive by blood smear for malaria. At the DNA isolation protocols were used 3: Heidari, Chelex®100 and commercial kit from Promega. In the nested PCR and conventional primers were used to identify P. falciparum and P. vivax. The results of the amplifications obtained with conventional PCR were similar to those obtained with nested PCR, demonstrating that have the same specificity and sensitivity, which allows to conclude that the realization of the conventional PCR is sufficient for the diagnosis of P. vivax and P. falciparum, reducing time and costs in the identification. The PCR is the best method for the diagnosis of Malaria, which is more sensitive and specific compared with rapid testing and microscopic examination of drop thick, allowing the presence of the parasite in the early stages of the disease when the parasite load is minimal, and also gives the possibility of identifying cases of mixed infections.
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    Acceso abierto
    Identificación de Arbovirus circulantes en una cohorte de pacientes con síndrome febril en el municipio de Villa del Rosario, Norte de Santander
    (Bucaramanga : Universidad de Santander, 2016, 2016-09-21) Carrillo Hernández, Marlen Yelitza; Martínez Gutiérrez, Marlen; Ruiz Saenz, Julian
    Los Virus Dengue (DENV), el Virus del Chikungunya (CHIKV) y el Virus Zika (ZIKV) son trasmitidos por el mismo vector, lo que resulta en la co-circulación de estos tres virus en las mismas regiones geográficas, aumentando la posibilidad de coinfecciones. El objetivo de este estudio fue identificar las cepas circulantes y calcular la prevalencia de co-infecciones en el municipio Villa del Rosario (Norte de Santander). Para lograr esto, con previo aval de bioética y consentimiento informado, se recolectaron muestras de suero de pacientes que presentaban fiebre menor de 7 días y con diagnóstico clínico compatible con alguna de estas tres enfermedades virales. Se extrajo el ARN de los sueros, posteriormente se realizó la retrotranscripción (RT) para obtener el cDNA, el cual fue utilizado como plantilla para la identificación de DENV y CHIKV (por PCR convencional) y ZIKV (por Real Time PCR). Las muestras positivas para DENV fueron serotipificadas y algunas muestras positivas para DENV y CHIKV fueron secuenciadas. Los resultados demostraron que 82 pacientes fueron positivos para uno o más virus: 33 (21.02%) para DENV, 47 (29.94%) para CHIKV y 29 (18.47%) para ZIKV. Adicionalmente, se encontró co-infección entre ellos: la prevalencia de co-infección DENV/CHIKV, DENV/ZIKV y CHIKV/ZIKV fue del 7.64%, 6.37% y 5.10%, con tasas de ataque de 14.90, 12.42 y 9.93 casos por cada 100.000 habitantes, respectivamente. Por otro lado, se encontraron tres pacientes co-infectados con los tres virus (prevalencia del 1.91%) con una tasa de ataque de 4.96 casos por 100.000 habitantes. Este estudio demuestra la simultánea co-circulación de DENV, CHIKV y ZIKV y sus co-infecciones en la región nororiente de Colombia.
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    Identificación y caracterización molecular de aislados de Burkholderia glumae, agente causante del añublo bacterial en el cultivo de arroz
    (2015) Galvis Serrano, Nestor Fabián; Carrillo Hernández, Marlen Yelitza
    El objetivo de este trabajo fue implementar la identificación especifica de Burkholderia glumae por PCR convencional; y conocer sus características genéticas, a partir de plantas de arroz con evidencia de pudrición. Burkholderia glumae es el agente causal del añublo bacterial de la panícula del arroz, con una alta incidencia ocasionando considerables pérdidas en la producción de los cultivos en Colombia. Debido a que su identificación es difícil, se requiere de un sistema de evaluación que permita determinar de manera rápida y precisa este patógeno. Se obtuvo 64 aislados, de los cuales 41 fueron identificados por Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) como Burkholderia glumae. La caracterización molecular con los marcadores MB1 y BOX-PCR mostraron variabilidad genética en la mayoría de los aislados, pero permitieron el agrupamiento de acuerdo a su origen geográfico. La gran diversidad genética encontrada refleja el alto grado de variabilidad existente dentro de los individuos de esta especie.