Examinando por Autor "Gómez-Duarte, Oscar G."
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- PublicaciónAcceso abiertoCase-Control Pilot Study on Acute Diarrheal Disease in a Geographically Defined Pediatric Population in a Middle Income Country(New York : Hindawi, 2017, 2017-08-10) Farfán García, Ana Elvira; Zhang, Chengxian; Imdad, Aamer; Arias Guerrero, Monica Y.; Sánchez Álvarez, Nayibe T.; Shah, Rikhil; Iqbal, Junaid; Tamborski, Maria E.; Gómez-Duarte, Oscar G.; Universidad de Santander; Hans Juergen LawsLa enfermedad diarreica aguda (EDA) es una causa común de morbilidad y mortalidad en los niños menores de 5 años. En la mayoría de los países de ingresos bajos y medios no se comprende la etiología del TDA porque los laboratorios de referencia detectan un número limitado de patógenos . El objetivo de este estudio fue determinar la viabilidad de realizar un estudio integral de casos y controles para examinar los patógenos diarreicos entre los niños con y sin TDA de moderado a grave. Materiales y métodos. Se utilizaron técnicas microbiológicas y moleculares para detectar enteropatógenos virales, bacterianos y parasitarios. El estudio se realizó en Bucaramanga, Colombia, luego de obtener la aprobación del Comité de Revisión Institucional. Resultados.Se reclutaron noventa niños menores de 5 años después de obtener un consentimiento informado por escrito de los padres o tutores. Cuarenta y cinco sujetos sirvieron como casos con ADD y 45 como controles. Treinta y seis sujetos de 90 (40,0%) fueron positivos para al menos un enteropatógeno, es decir, 20 (44,4%) casos y 16 (35,5%) controles. Conclusiones. Los tres patógenos entéricos más comunes fueron E. coli enteroagregativa (10.0%), Norovirus (6.7%) y Salmonella spp. (5,6%). Los patógenos de E. coli fueron el 18,8% de todas las infecciones, lo que los convierte en los patógenos más frecuentes. La mitad de los casos de TDA fueron negativos para cualquier patógeno.
- PublicaciónAcceso abiertoEnteroinvasive Escherichia coli O96:H19 is an Emergent Biofilm-Forming Pathogen(2022-03-28) Iqbal, Junaid; Malviya, Niharika; Gaddy, Jennifer A.; Zhang, Chengxian; Seier, Andrew J.; Haley, Kathryn P.; Doster, Ryan S.; Farfan-Garcia, Ana Elvira; Gómez-Duarte, Oscar G.; CliniUDESEnteroinvasive Escherichia coli (EIEC) is a diarrheagenic E. coli pathotype carrying a virulence plasmid that encodes a type III secretion system (TTSS) directly implicated in bacterial cell invasion. Since 2012, EIEC serotype O96:H19 has been recognized in Europe, Colombia, and most recently Uruguay. In addition to the invasion phenotype, the strains isolated from Colombian children with moderate-to-severe gastroenteritis had a strong biofilm formation phenotype, and as a result, they are referred to as biofilm-forming enteroinvasive E. coli (BF-EIEC). The objective of this study was to characterize the biofilm formation phenotype of the BF-EIEC O96:H19 strain 52.1 isolated from a child with moderate-to-severe gastroenteritis in Colombia. Random mutagenesis using Tn5 transposons identified 100 mutants unable to form biofilm; 20 of those had mutations within the pgaABCD operon. Site-directed mutagenesis of pgaB and pgaC confirmed the importance of these genes in N-acetylglucosamine-mediated biofilm formation. Both biofilm formation and TTSS-mediated host cell invasion were associated with host cell damage on the basis of cytotoxic assays comparing the wild type, invasion gene mutants, and biofilm formation mutants. Multilocus sequence typing-based phylogenetic analysis showed that BF-EIEC strain 52.1 does not cluster with classic EIEC serotype strains. Instead, BF-EIEC strain 52.1 clusters with EIEC serotype O96:H19 strains described in Europe and Uruguay. In conclusion, BF-EIEC O96:H19, an emerging pathogen associated with moderate-to-severe acute gastroenteritis in children under 5 years of age in Colombia, invades cells and has a strong biofilm formation capability. Both phenotypes are independently associated with in vitro cell cytotoxicity, and they may explain, at least in part, the higher disease severity reported in Europe and Latin America. IMPORTANCE Enteroinvasive Escherichia coli (EIEC), a close relative of Shigella, is implicated in dysenteric diarrhea. EIEC pathogenicity involves cell invasion mediated by effector proteins delivered by a type III secretion system (TTSS) that disrupt the cell cytoskeleton. These proteins and the VirF global regulator are encoded by a large (>200 kb) invasion plasmid (pINV). This study reports an emergent EIEC possessing a cell invasion phenotype and a strong polysaccharide matrix-mediated biofilm formation phenotype. Both phenotypes contribute to host cell cytotoxicity in vitro and may contribute to the severe disease reported among children and adults in Europe and Latin America.
- PublicaciónAcceso abiertoEtiology of acute gastroenteritis among children less than 5 years of age in Bucaramanga, Colombia.(San Francisco : Plos One, 2020., 2020-06-30) Farfán García, Ana Elvira; Imdad, Aamer; Zhang, Chengxian; Arias Guerrero, Monica Y.; Sánchez Álvarez, Nayibe T.; Iqbal, Junaid; Hernández-Gamboa, Adriana E.; Slaughter, James C.; Gómez-Duarte, Oscar G.; Universidad de Santander; Abiola Senok, Mohammed Bin RashidLa gastroenteritis aguda (GEA) es una de las principales causas de mortalidad en niños menores de 5 años en países de ingresos bajos y medianos (PIBM). La mayor carga de la enfermedad AGE se concentra en áreas tropicales donde las poblaciones carecen de acceso a agua potable, saneamiento e higiene adecuados, lo que hace que esta afección sea una enfermedad desatendida. La información limitada sobre la etiología, la desnutrición asociada y la mortalidad entre las comunidades desatendidas dificulta el desarrollo de estrategias para la prevención y el tratamiento de los AGE. Este estudio de casos y controles en niños menores de 5 años en Bucaramanga, Colombia, reveló que los organismos virales seguidos de bacterias explicaron la mayor proporción de AGE, siendo el norovirus el organismo más común. La mayor tasa de infecciones y coinfecciones entre los casos en comparación con los controles se asoció con AGE.E . coli entre los casos designados como E enteroinvasores formadores de biopelículas . coli (BF-EIEC), E enteroagregativa / enteropatógena . coli y E. enteroagregativa / enterotoxigénica . coli (EAEC / ETEC).
- PublicaciónAcceso abiertoIb-M6 Antimicrobial Peptide(Basilea : MDPI, 2020, 2020-02-12) Flórez Castillo, Johanna-Marcela; Rondón Villarreal, Paola; Ropero Vega, José Luis; Mendoza Espinel, Stephany Y.; Moreno Amézquita, July A.; Méndez Jaimes, Karen D.; Farfán García, Ana Elvira; Gómez Rangel, Sergio-Yebrail; Gómez-Duarte, Oscar G.; Universidad de SantanderEl péptido Ib-M6 tiene actividad antibacteriana contra la cepa K-12 de Escherichia coli no patógena . La primera parte de este estudio determina la actividad antibacteriana de Ib-M6 contra catorce cepas patógenas de E. coli O157: H7. El ensayo de susceptibilidad mostró que Ib-M6 tenía valores de Concentración Inhibitoria Mínima (MIC) más bajos que la estreptomicina, usada como antibiótico de referencia. Además, para predecir la posible interacción entre Ib-M6 y los componentes de la membrana externa de E. coli, utilizamos simulaciones de acoplamiento molecular donde la proteína FhuA y su complejo con Lipopolisacárido (LPS-FhuA) se utilizaron como objetivos del péptido. Los complejos FhuA / Ib-M6 tenían valores de energía entre -39,5 y -40,5 unidades de energía Rosetta (REU) y solo un enlace de hidrógeno. En contraste, los complejos entre LPS-FhuA e Ib-M6 mostraron valores de energía entre -25,6 y -40,6 REU, y la presencia de cinco posibles enlaces de hidrógeno. Por tanto, la actividad antimicrobiana del péptido Ib-M6 mostrada en los ensayos experimentales podría deberse a su interacción con la membrana externa de E. coli .