ACK. Maestría en Investigación en Enfermedades Infecciosas
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Formar profesionales con una sólida fundamentación en investigación, capaces de apropiar de forma integral el papel de la biología de los agentes infecciosos y sus huéspedes sobre la infección resultante. Nuestros egresados tienen competencia para aplicar estos conocimientos e integrarlos a los enfoques epidemiológicos y de salud pública, con miras al desarrollo y evaluación de estrategias racionales para el diagnóstico, vigilancia y control de las afecciones infecciosas, resultando en un impacto positivo sobre la Salud y la calidad de vida de las poblaciones en las que ejercen. En todo sentido, el Magister en Investigación en Enfermedades Infecciosas es educado para la ciudadanía y para la participación plena en la sociedad.
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- PublicaciónAcceso abiertoIdentificación de Arbovirus circulantes en una cohorte de pacientes con síndrome febril en el municipio de Villa del Rosario, Norte de Santander(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2016, 2016-09-21) Carrillo Hernández, Marlen Yelitza; Martínez Gutiérrez, Marlen; Ruiz Saenz, JulianLos Virus Dengue (DENV), el Virus del Chikungunya (CHIKV) y el Virus Zika (ZIKV) son trasmitidos por el mismo vector, lo que resulta en la co-circulación de estos tres virus en las mismas regiones geográficas, aumentando la posibilidad de coinfecciones. El objetivo de este estudio fue identificar las cepas circulantes y calcular la prevalencia de co-infecciones en el municipio Villa del Rosario (Norte de Santander). Para lograr esto, con previo aval de bioética y consentimiento informado, se recolectaron muestras de suero de pacientes que presentaban fiebre menor de 7 días y con diagnóstico clínico compatible con alguna de estas tres enfermedades virales. Se extrajo el ARN de los sueros, posteriormente se realizó la retrotranscripción (RT) para obtener el cDNA, el cual fue utilizado como plantilla para la identificación de DENV y CHIKV (por PCR convencional) y ZIKV (por Real Time PCR). Las muestras positivas para DENV fueron serotipificadas y algunas muestras positivas para DENV y CHIKV fueron secuenciadas. Los resultados demostraron que 82 pacientes fueron positivos para uno o más virus: 33 (21.02%) para DENV, 47 (29.94%) para CHIKV y 29 (18.47%) para ZIKV. Adicionalmente, se encontró co-infección entre ellos: la prevalencia de co-infección DENV/CHIKV, DENV/ZIKV y CHIKV/ZIKV fue del 7.64%, 6.37% y 5.10%, con tasas de ataque de 14.90, 12.42 y 9.93 casos por cada 100.000 habitantes, respectivamente. Por otro lado, se encontraron tres pacientes co-infectados con los tres virus (prevalencia del 1.91%) con una tasa de ataque de 4.96 casos por 100.000 habitantes. Este estudio demuestra la simultánea co-circulación de DENV, CHIKV y ZIKV y sus co-infecciones en la región nororiente de Colombia.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización genotípica y fenotípica de cepas emergentes de Escherichia coli aisladas de niños con diarrea en Bucaramanga y su área metropolitana, Colombia.(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2016, 2016-10-21) Arias Guerrero, Monica Y.; Gómez Duarte, Oscar Gilberto; Farfán García, Ana ElviraAcute diarrheal disease (ADD) remains a major public health problems in developing countries. Among the infectious agents that cause this disease are bacteria, viruses and parasites. Bacterial agents take second place enteropathogenic Escherichia coli standing out among the most important. Currently, six strains with different pathogenic mechanisms are associated with diarrhea enteropathogenic E. coli (EPEC), shiga-toxin producing (STEC), enterotoxigenic (ETEC), enteroinvasive (EIEC), Enteroaggregative (EAEC) and diffusely adherent (DAEC), each with a specific set of virulence genes. However, there have been outbreaks of ADD caused by E. coli strains different from the known pathotypes, called emerging strains. These outbreaks have been reported in Germany, Europe, Argentina and recently in Cartagena, Colombia, suggesting that these strains circulating our environment, so it is necessary to characterize these emerging strains. Objective: To characterize genotypically and phenotypically two emerging strains of E. coli isolated from diarrheal samples in children under five in Bucaramanga and its metropolitan area, Colombia. Methods: A descriptive study was conducted at the genetic and phenotypic two emerging strains previously isolated from a case-control study conducted between July 2013 and December 2014 in Bucaramanga and its metropolitan area. In this study, two emerging strains were characterized by phenotypic and genotypic different methods like MLST analysis, virulence gene sequencing, serotyping, biofilm formation, actin polymerization, adhesion tests and antimicrobial susceptibility. Results: genotypically and phenotypically characterized two emerging strains of E. coli mixed genotype. The first one enteropathogenic E coli enteroaggregative-mixed based on its genotype and phenotype of adhesion assays in HeLa cells and the second a strain of enterotoxigenic E. coli enteroaggregative-mixed based on its genotype and expression of LT. Keywords: Diarrhea, Escherichia coli, pathotypes, emerging, Colombia.
- PublicaciónAcceso abiertoEvaluación in vitro del efecto antiviral de compuestos derivados de plantas de la Región Caribe Colombiana sobre la infección por Virus Dengue y Virus Chikungunya(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2016, 2016-10-21) Gómez Calderón, Cecilia; Martínez Gutiérrez, MarlenThe transmission of Dengue virus (DENV) and Chikungunya virus (CHIKV) has increased worldwide, due in part to the lack of a specific antiviral treatment. For this reason, the search for compounds with antiviral potential, either as licensed drugs or in natural products, is a research priority. The objective of this study was to identify some of the compounds that are present in Mammea americana (M. americana) and Tabernaemontana cymosa (T. cymosa) plants and, subsequently, to evaluate their cytotoxicity in VERO cells and their potential antiviral effects on DENV and CHIKV infections in those same cells. Dry ethanolic extracts of M. americana and T. cymosa seeds were subjected to open column chromatographic fractionation, leading to the identification of four compounds (with two coumarins, namely lupeol acetate, and voacangine). The cytotoxicity of each compound was subsequently assessed by the MTT method (at concentrations from 400 to 6.25 μg/mL). Pre- and post-treatment antiviral assays were performed at non-toxic concentrations; the resulting DENV inhibition was evaluated by Real-Time PCR, and the CHIKV inhibition was tested by the plating method. The results were analyzed by means of statistical analysis. The compounds showed low toxicity at concentrations ≤ 200 μg/mL. The compounds coumarin A and coumarin B, which are derived from the M. americana plant, significantly inhibited infection with both viruses during the implementation of the two experimental strategies employed here (posttreatment with inhibition percentages greater than 50%, p < 0.01; and pre-treatment with percentages of inhibition greater than 40%, p < 0.01). However, the lupeol acetate and voacangine compounds, which were derived from the T. cymosa plant, only significantly inhibited the DENV infection during the post-treatment strategy (at inhibition percentages greater than 70%, p < 0.01). In vitro, the coumarins are capable of inhibiting infection by DENV and CHIKV (with inhibition percentages above 50% in different experimental strategies), which could indicate that these two compounds are potential antivirals for treating Dengue and Chikungunya fever. Additionally, lupeol acetate and voacangine efficiently inhibit infection with DENV, also turning them into promising antivirals for Dengue fever.
- PublicaciónAcceso abiertoDetección de agentes virales diarreagénicos en niños menores de cinco años en Bucaramanga y su área metropolitana(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2016, 2016-10-21) Sánchez Álvarez, Nayibe T.; Farfán García, Ana Elvira; Gómez Duarte, Oscar GilbertoAcute diarrheal disease (ADD), the highest prevalence in children under five. It can be caused by bacteria, parasites and / or viruses mainly. The diagnosis of gastrointestinal viral infections is limited by the high costs of molecular techniques and the lack of health personnel about its clinical importance. Reported studies of these infections in Colombia are scarce. Objective: To identify the frequency of viral agents associated EDA phylogenetic level and characterize the two most common viral agents. Materials and Methods: From biological material collected from a previous case-control study of 405 children with EDA and 405 controls, an analytical study. Stool samples were processed by molecular methods for the detection of adenovirus, norovirus, sapovirus, astrovirus and rotavirus. Additionally, direct ELISA was used for the detection of rotavirus antigen. Phylogenetic analysis was performed to norovirus and rotavirus by amplifying target gene fragment C region capsid proteins VP4 and VP7 and respectively. Results: Among the 810 samples positive for the virus was detected in 30,1%, 45,4% in cases and 14,8% in controls. The most prevalent virus norovirus GII was 10,9%, followed by rotavirus and sapovirus with 5,1% each. Adenovirus, astrovirus and norovirus GI were detected in percentages ranging from 1,7 to 3,8%. The highest frequency of virus was observed in the age ranges of 12 to 23 months and 24-59 months. GII Norovirus was the most prevalent in cases with symptoms of diarrhea and vomiting in 93 and 88,8% respectively. The most common norovirus genotypes were GI.2 and GII.4 and the most common rotavirus genotypes were G12P8 and G9P8. Conclusions: 6 virus identification was achieved in stool samples of children under five years. The most frequently isolated viral agent was norovirus and most important subtype was norovirus GII. The importance of virus in the epidemiology of EDA and high genetic diversity of genotypes of norovirus and rotavirus in a pediatric population of Bucaramanga and its metropolitan area, Colombia was demonstrated.
- PublicaciónAcceso abiertoAsociación de la percepción del riesgo y la experiencia con los conocimientos actitudes y prácticas sobre el dengue en la población de Riohacha, La Guajira, Colombia(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2017, 2017-05-22) Benítez Díaz, Liliana; Martínez Vega, Ruth Aralí; Díaz Quijano, Fredi AlexanderEl dengue es una enfermedad endémica en La Guajira y su capital Riohacha, aporta la mayoría de los casos reportados por la región. Siguiendo las recomendaciones de la OMS para el control del dengue, las cuales enfatizan en la importancia de la movilización social y la comunicación en salud, para lograr cambios de comportamiento en la comunidad, orientados hacía la eliminación de criaderos de mosquitos, se ha propuesto realizar una investigación para estimar la asociación entre la percepción del riesgo y la experiencia de casos de dengue con los conocimientos, actitudes y prácticas (CAP) sobre dengue, en la población de Riohacha, La Guajira, con el fin de planear programas de intervención adaptados a las necesidades y realidades de la localidad. Para ésto se diseñó un estudio analítico de corte transversal, mediante muestreo probabilístico, polietápico por conglomerados, los datos recolectados se analizaron para su descripción y se ajustaron modelos de regresión log binomial o de Poisson opción robusta, con los que se establecieron las asociaciones. Se entrevistaron 206 familias y menos del 10% saben la naturaleza viral del dengue y menos del 40% identificaron otros síntomas diferentes a la fiebre. En cuanto a las prácticas, menos del 40% de la población realiza eliminación de criaderos y el 58% fumiga. La participación en actividades comunitarias fue menor del 30% en la mayoría de ellas, sin embargo, más del 80% de la población percibe el riesgo de dengue. El análisis multivariado mostró una asociación significativa entre la percepción del riesgo con el conocimiento sobre el vector (RP=3,32 IC95% 1,06–10,36) y la experiencia de dengue con la actitud frente al control del dengue (RP=1,61 IC95% 1,09–2,37). En conclusión, la percepción del riesgo y la experiencia con dengue podrían jugar un papel determinante en los CAP frente al control del dengue.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización de la actividad tripanocida y citotóxica de aceites esenciales de lippia alba y sus terpenos bioactivos sobre trypanosoma cruzi(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2017, 2017-06-09) Moreno Moreno, Erika Marcela; García Sánchez, Liliana Torcoroma; Leal Pinto, Sandra-MilenaLa Enfermedad de Chagas es una infección causada por el protozoario Trypanosoma cruzi, la cual es caracterizada por un prolongado curso silencioso y complejas manifestaciones clínicas. Actualmente, no existe evidencia contundente de quimioterapéuticas eficaces, lo que hace obligatoria la búsqueda de nuevos agentes tripanocidas más efectivos. Bajo este escenario, fármacos extraídos de plantas resultan prometedores, teniendo en cuenta su baja toxicidad y amplio espectro farmacológico. De acuerdo con esto, en este trabajo se evaluó la actividad tripanocida in vitro de aceites esenciales (AEs) de Lippia alba y de sus terpenos bioactivos (óxido de cariofileno, citral, limoneno y carvona), caracterizándose el mecanismo de muerte celular inducido contra T.cruzi. Los resultados fueron expresados como la concentración inhibitoria o citotóxica 50 (CI50 y CC50, respectivamente), realizando regresión sigmoidal mediante el Software estadístico MsxlfitTM. El fenotipo de muerte fue rastreado por microscopía óptica y de fluorescencia, citometría de flujo y electroforesis de ADN. El análisis estadístico se realizó por ANOVA de Welch (software SPSS 15.0). En las condiciones testadas, los AEs y terpenos de L. alba ejercieron efectos inhibitorios distintos en los tres estadios parasitarios evaluados (p=0.000). Los AEs del quimiotipo Citral exhibieron concentraciones inhibitorias medias menores (Epimastigotes: CI50 13,6±1,5μg/mL; Tripomastigotes: CI50 21,9±1,4 μg/mL; Amastigotes: CI50 74,1±4,4μg/mL) que las alcanzadas con los aceites del quimiotipo Carvona (Epimastigotes: CI50 88,2±3,7μg/mL; Tripomastigotes: CI50 44,9±2,5μg/mL; Amastigotes: CI50 >150μg/mL). El limoneno representó el terpeno de mayor selectividad (Epimastigotes: IS 7,1; Tripomastigotes: IS 32,8; Amastigotes: IS 10,3) y menor toxicidad sobre células Vero (Limoneno: CC50 297,1±2,4μg/mL). Además, el limoneno evidenció una interacción sinérgica in vitro con el Benznidazol (Epimastigotes CIF=0,44±0,13; tripomastigotes CIF=0,42±0,10; amastigotes CIF=0,58±0,13μg/mL) y con el óxido de cariofileno (Epimastigotes: CIF 0,49; Tripomastigotes: CIF 0,45; Amastigotes: CIF 0,71μg/mL). Los análisis celulares sugieren que la muerte celular observada en el T. cruzi podría ser mediada por un mecanismo tipo-apoptótico.
- PublicaciónAcceso abiertoSusceptibilidad a antibióticos en patógenos aislados de niños hospitalizados y ambulatorios en centros hospitalarios de las ciudad de Bogotá, D.C. 2010-2015(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2017, 2017-08-25) De La Hoz Celis, Rodolfo A.; Aguilar Jiménez, Jhancy Rocío; Díaz Quijano, Fredi AlexanderThe increase in resistance to antibiotics, constitutes a threat to human health and one of the biggest concerns in the world. For this reason, since 2001, the Group for the Control of Antimicrobial Resistance in Bogota (GREBO) has implemented a surveillance system according to the World Health Organization. Objective. To determine the antimicrobial resistance profile of bacteria isolated from pediatric patients in the hospital and outpatient settings of public and private institutions of the city of Bogotá D.C., from January 2010 to December 2015. Methodology. A retrospective descriptive observational study was performed. We included 61,347 bacterial isolates of pediatric patients from the hospital, pediatric ICU, neonatal ICU and outpatient clinics of ten public and private institutions in the city of Bogotá. We studied secondary source variables related to demographic and clinical aspects of patients, as well as those related to clinical laboratory diagnosis. The antibiotics to be analyzed were defined according to the established clinical protocols and the corresponding antibacterial spectrum. Stata 12.0 © was used for the statistical analysis and frequency, central tendency and dispersion measures were used. Results. It was evidenced an increase of E.coli resistance from the year 2010 to 2015. Antibiotics such as ampicillin Sulbactam, Cefotaxime, Cefepime, Ertapenem have lost sensitivity to this germ. Imipenem, Meropenem and Amikacin maintained good sensitivity patterns for S. aureus and there was no significant decrease in sensitivity to oxacillin. Conclusion. Socializing the interior of health institutions, the results of surveillance systems in antibiotic resistance, ensure adequate treatments and improve the resistance patterns of some bacteria to antibiotics.
- PublicaciónAcceso abiertoCardioprotección por antioxidantes mitocondriales en cardiomiocitos humanos infectados con Trypanosoma cruzi(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2017, 2017-10-15) Rodríguez Avila, Yudy A.; López Casillas, MarcosLa cardiomiopatía chagásica es el evento más serio y más frecuente de la enfermedad de chagas. La invasión por T. cruzi genera alteraciones en la función mitocondrial del cardiomiocito que se traducen a pérdida del potencial de membrana mitocondrial, generación de especies reactivas de oxígeno ROS y alteración en el balance antioxidante, contribuyendo a un desequilibrio metabólico y oxidativo en el miocardio chagásico. Nosotros evaluamos los efectos de nitróxidos miméticos de SOD (SG1 y Mito-SG1) y del tratamiento de referencia BZN sobre la capacidad pro-oxidante, la bioenergética celular e infectividad de cardiomiocitos humanos AC16 infectados con T. cruzi. Materiales y Métodos: La citotoxicidad celular fue realizada por el ensayo MTT. La infectividad parasitaria fue determinada por citometría de flujo, utilizando el reactivo CFSE. La bioenergética celular se determinó con el sistema Seahorse XFe-24 Analyzer y la producción de ROS Mitocondrial por MitoSOX™ Red. Resultados: El CC50 para SG1 fue de 4790 μM, para Mito-SG1 de 5,0 μM. BZN y Mito-SG1 tuvieron efectos en la disminución de la tasa de infectividad de los cardiomiocitos humanos. Se obtuvo diferencias significativas en los efectos pro-oxidantes de los cardiomiocitos tratados con BZN. Se observaron cambios importantes estadísticamente en los parámetros de respiración basal, producción de ATP, protón leak y respiración máxima en los cardiomiocitos infectados con T. cruzi. La capacidad de reserva respiratoria disminuyo en los cardiomiocitos infectados y sometidos a los tratamientos con BZN, SG1 y Mito-SG1. Conclusiones: El cardiomiocito humano sufre perturbaciones metabólicas tempranas que involucran cambios en el consumo de oxígeno y perfil bioenergético hacia la utilización de la vía glucolítica. La disminución de la infectividad en los cardiomiocitos tratados con Mito-SG1, es un hallazgo que permite realizar estudios futuros con el fin de determinar posibles efectos antiparásitarios del mitocompuesto.
- PublicaciónAcceso abiertoExpresión del receptor tipo toll 4 en células deciduales estromales humanas asociadas a complicaciones del embarazo(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-04-09) Granados Cuao, Jersson-Luis; Blanco Muñoz, OsmanyLa Pre-eclampsia (PE) es una enfermedad multisistémica sin causa conocida que afecta entre el 5-7% de mujeres embarazadas, siendo una de las principales causas de morbilidad y mortalidad materno-fetal en todo el mundo. La asociación entre infección e inflamación es considerada la causa principal de complicaciones como la PE, con aumento de citoquinas favoreciendo la disfunción endotelial en placenta. Las células deciduales estromales (DSC) constituyen el principal componente celular de la decidua y protegen al feto frente a bacterias Gram negativas y señales de peligro que emanan de inflamación severa con o sin infección. A través de la expresión del receptor tipo Toll 4 (TLR4) las DSC regulan la respuesta inmune innata durante la infección. El objetivo fue analizar el comportamiento inmunomodulador in vitro de las DSC a partir de PE. Materiales y métodos: estudio analítico de casos y controles. Las DSC fueron aisladas y cultivadas a partir de tejido placentario, de pacientes con parto vaginal sin complicaciones (control, n=6) y parto por cesárea con pre-eclampsia (PE, n=6). La caracterización fenotípica de las DSC se efectuó mediante análisis por citometría de flujo. La expresión del ARN mensajero del TLR4 se cuantificó por RT-PCR en tiempo real. Finalmente, la determinación de citoquinas se realizó por medio de ELISA a partir de sobrenadantes de cultivos celulares. Resultados: la expresión de antígenos característicos fue similar en las DSC estudiadas (CD10, CD29, CD44, CD73 y CD90). La expresión génica del TLR4, no presentó diferencia significativa (p=0,136). Las DSC control secretaron mayor cantidad de IL-6 (media=3631,7pg/mL) en comparación con las de PE (760pg/mL). La secreción de IL-10 presento diferencia significativa (control=4pg/mL, PE11,2pg/mL). Conclusiones: las DSC control y PE no presentaron diferencias significativas en la expresión del TLR4, se sugiere un papel protector a nivel placentario
- PublicaciónAcceso abiertoDetección y genotipificación del virus de papiloma humano en mujeres de una población vulnerable de la zona norte de Bucaramanga(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-04-09) Torrado García, Laura M.; Rincón Orozco, Bladimiro; Martínez Vega, Ruth AralíAnnually more than 500 thousand women are affected by Uterine Cervical Cancer (UCC) worldwide. Persistent infection with high-risk human papilloma virus (HPV-HR) is a necessary cause for the onset of this cancer. Objective: To determine the prevalence of HPV infection in a vulnerable population of the northern zone of Bucaramanga. Methods: A descriptive cross-sectional study was carryout in women aged 35 to 65 years with moderate or high risk (≥3 points) to develop UCC, determined by a standardized epidemiological survey. In a cérvico-vaginal sample, obtained by self-sampling, molecular tests were performed by polymerase chain reaction and dot-blot hybridization using the HPV Direct Flow CHIP system. Results: A total of 810 women were surveyed; 435 (53.7%) of them underwent self-sampling because they presented moderate or high risk. Their median age was 47.3 years (RIQ 41-53 years); 55.1% (n = 237) studied until primary. Almost the entire population resided in Strata 1 and 2 (98.8%) and most of them were from the subsidized social security system (87.2%); 95.1% (n = 355) had at least one pregnancy. We found a prevalence for HPV infection of 10.6% (CI 95%: 7,8 – 13,8; n = 434), for HPV-HR of 3.9% (CI 95%: 2,3 – 6,2; n = 17), for low risk HPV (HPV-LR) of 3.5% (CI 95%: 1,4 – 5,6; n = 15), for undetermined genotype of 1.9% (n = 8) and for coinfections HPV 1,3% (IC 95%: 0,5 – 3,0; n=6). The most common HPV-HR genotype was HPV-59 (n = 4) and HPV-LR was HPV-62 / 81 (n = 7). There was coinfection with HPV-HR and HPV-LR in five women and coinfection with two HPV-LR in one woman. Conclusion: The frequency of HPV-AR genotypes found varies from what is commonly reported until now. HPV-16 was not the most prevalent genotype and HPV-18 was not present in any of the samples analyze
- PublicaciónAcceso abiertoRelación de la incidencia de leishmaniasis cutánea y mucosa, con las zonas de mayor alteración de la temperatura y la precipitación inducida por los fenómenos de el niño y la niña en Colombia(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-04-09) Díaz Díaz, Rolando; Martínez Vega, Ruth Aralí; Gutiérrez, Juan DavidLeishmaniasis is a vector-borne disease caused by protozoan parasite, it is transmitted by Lutzomiya. It is considered as a neglected disease by WHO, millions of people are exposed to contract the disease. Colombia, presents meteorological variations, with some climatic phenomena such as El Niño and La Niña in some periods of time, which may be associated with an increase in the cases of mucosal leishmaniasis (LM) and cutaneous leishmaniasis (LC). Materials and methods: Ecological study of time series was carried out, from a secondary source of information. The objective was to determine the relationship between LM and LC incidences and the variation of temperature and the variation of precipitation, also and El Niño y La Niña during the period between 2007 and 2015. The information used was obtained from SIVIGILA, DANE and IDEAM. A multilevel Poisson regression was performed to calculate the incidence rate ratio (IRR). Results: The variation of precipitation with a delay of three months and La Niña with two months of delay were associated with the decrease in the incidence rate of LC (IRRa 0.97 CI95% 0.95 - 0.99; IRRa 0.80 CI95% 0.78 - 0.83) and El Niño was associated with an increase in the incidence rate (IRRa 1.27 CI95% 1.23-1.32). Additionally, the variation of temperature with a month of delay was associated to the decrease of the LM rate (IRR 0.8 CI95% 0.68 - 0.95); on the contrary, the variation of the precipitation with three months of delay, increased the LM rate (IRR 1.21 CI95% 1.03 - 1.42). Conclusions: This information could use to improve the ability for planning specific prevention and mitigation strategies, through the generation of early warnings using public availability information.
- PublicaciónAcceso abiertoDeterminación de la inhibición de quorum sensing por la variante lactonasa 852 sobre la producción de biopelículas en bacterias gram negativas multidrogoresistentes.(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-04-09) Gallardo Castro, Johana A.; Rueda Forero, Nohora Juliana; Florez, Alvaro M.La regulación de la expresión génica asociada a la producción de biopelículas en bacterias Gram negativas es mediada por Quórum Sensing (QS). Estudios previos han demostrado la degradación de señales QS de la variante lactonasa epp852 y la atenuación in vitro de infecciones producidas por Pectobacterium carotovorum, Agrobacterium tumefaciens y Pseudomonas aeruginosa PAO1. Materiales y Métodos: se investigó la inhibición de señales QS y la formación de biopelículas en bacterias Gram negativas multidrogoresistentes, empleando la lactonasa recombinante epp852. Se tamizaron cepas provenientes de muestras clínicas, previamente aisladas e identificadas con patrón de resistencia antibiótica. Se evaluó la producción de señales QS dependientes de acíl homoserina lactona (AHL) mediante el biosensor Chromobacterium violaceum. Se cuantificó la violaceína producida y se determinó la formación de biopelículas mediante la microtitulación en placa y cuantificación de cristal violeta. Las cepas que produjeron señales AHLs y formaron biopelículas se sometieron a estudios de inhibición QS con la lactonasa recombinante epp852. Resultados: se identificaron 29 aislamientos Gram negativos con fenotipos de resistencia y sensibilidad antibiótica que producen señales AHL. En el aislamiento 92, S. marcescens productora de betalactamasa, se obtuvo una inhibición del 98.12%, en la formación de la biopelícula y para el aislamiento 28, P. aeruginosa sensible se obtuvo una reducción en el índice de formación de biopelícula del 36.4%. Se observó diferencia estadísticamente significativa al comparar el tratamiento con lactonasa para P. aeruginosa (P= 0,038) y S. marcescens (P= 0,028) Conclusiones: El efecto de la atenuación de la variante epp852 en microorganismos patógenos, permite el desarrollo de nuevas estrategias biomédicas para el control de las infecciones originadas por bacterias Gram negativas multidrogo resistentes.
- PublicaciónAcceso abiertoFactores asociados a la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo en mujeres de la comuna norte de Bucaramanga.(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-04-09) Bohórquez Pérez, Raitza A.; Rincón Orozco, Bladimiro; Martínez Vega, Ruth AralíThe development of cervical cancer (CCU) has a necessary cause that is persistent infection with the human papillomavirus (HPV) at high risk. 80% of sexually active women become infected with HPV at least once in their lives, but only a proportion develops CCU. Viral persistence or elimination has been associated to multiple factors, some of which are modifiable. These factors vary according to the population characteristics, geographical areas and development indexes. General Objective: To determine factors associated with the prevalence of high-risk HPV infection in women aged 30 to 65 years in the northern zone of Bucaramanga. Methods: An analytical cross-sectional study was conducted where women between 30 and 65 years of age living in the northern zone of Bucaramanga were evaluated. Women classified as moderate / high risk for CCU in a short standardized survey were conducted an expanded survey of potential factors associated with infection, followed by a sample by self-sampling of the cervix, which was used for viral DNA detection. Bivariate analysis and multiple analysis of negative binomial regression were performed to detect associated factors. Results: 810 women were surveyed, of these 435 had moderate / high risk of CCU and self-sampling was performed. The prevalence of infection by HPV-RA was 5.1% (95% CI 3.2-7.6) and this was higher in women over 54 years (9.9%). It was found that sedentary lifestyle (RPa 2.51, 95% CI 1.15-5.50) and overweight / obesity (PRa 4.20, 95% CI 1.00-15.51) were associated with a higher prevalence of HPV- AR. In addition, there was an increasing trend in the prevalence of infection by HPV-AR in users of injectable contraceptives (RPa 2.81, 95% CI 0.95-8.34) Conclusions: Factors sedentary lifestyle and overweight / obesity, independently associated with a higher prevalence of HPV-AR infection.
- PublicaciónAcceso abiertoIdentificación de moléculas naturales con potencial actividad antibacteriana, contra bacterias gram positivas, a través del análisis in silico de propiedades fisicoquímicas de dos librerías de compañías farmacéuticas(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-06-26) Cortez Gómez, Frank L.; Rondón Villarreal, PaolaAntibiotic resistance is a threat to human health, with increasing reports of multiple resistant multidrug bacteria and few advances in research for more than 20 years (Kelley et al., 2011). In the search for a solution, molecules of natural origin can be a good alternative for the appearance of new antibiotics (Taylor, 2013). In addition, rational drug design allows the in silico analysis of molecules by computational tools, and this can increase the chances of identifying biologically effective compounds of natural origin against bacteria. Among these in silico tools, there are QSAR techniques that analyze the relationship between structure and biological activity, in models to predict the activity of a molecule (Cox et al., 2013, Soukup et al., 2016). On the other hand, the use of computational tools such as QSAR, also allows to calculate physicochemical kind, electrophysical properties, possible interactions, binding sites, drug-eligibility and toxicity, through the use of mathematical models and statistical tools that allow the analysis of a large amount of data (Shin et al., 2017; McPhillie et al., 2015; Cherkasov et al., 2014). Therefore, in this degree work, computational tools were used to establish design rules (in the absence of clear rules for this purpose) for molecules with antibacterial activity against gram-positive and drug-eligible bacteria, which were subsequently used to select natural molecules from the bookshop of the Interbioscreen company with potential antibacterial activity (https://www.ibscreen.com/natural-compounds). The use of these computational tools allowed to significantly reduce the space of possible molecules to be analyzed in future experimental tests, going from a set of 66,107 possible molecules to just a list of 257 candidate molecules.
- PublicaciónAcceso abiertoEvaluación in vitro de la actividad antifúngica y citotóxica del eugenol y sus derivados semisintéticos frente a Trichophyton spp(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-06-26) Rivera Rincón, Yohana; Leal Pinto, Sandra-MilenaDermatophytes are keratinophilic fungi that infect tissues such as skin, hair and nails in humans and animals. The treatment is based on topical, systemic and / or combined therapies with low penetrability, varied effectiveness and adverse effects that make it a challenge to research new natural bioactive molecules. The general objective was to evaluate the antifungal and cytotoxic activity in vitro of the semisynthetic compounds derived from eugenol in fungi of the genus Trichophyton. The antifungal susceptibility of twelve eugenol derivatives was evaluated against: Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton rubrum and Trichophyton tonsurans. The MIC was determined by the microdilution method established by CLSI, subcultures from MIC, were incubated for 7 days at 30 ° C to determine MFC. In addition, the inhibition of the radial growth of the mycelium was evaluated by the substrate technique impregnated for 20 days. Likewise, in vitro toxicity in Vero cells was tested by a colorimetric assay, using the MTT tetrazolium salt. Terbinafine used as reference drug. EO, eugenol and derivatives 5,10,11 and 12 showed inhibition of T. mentagrophytes MIC 62.5-500 μg / mL and MFC 125-500 μg/mL Eugenol, derivatives 3,5 and 11 inhibited T. rubrum MIC and MFC 125-250 μg/mL EO, eugenol, compound 11 and 12 inhibited T. tonsurans with MIC and MFC 125-250 μg/mL 100% inhibition of mycelial growth of the three dermatophytes was observed after exposure with 300ug/mL and 100 ug/mL of derivatives 3,5,7-12 and 3, 7-9,12, respectively. Low toxicity in Vero cells was observed (CC50 54.06- <300 ug/mL). New bioactive molecules with antifungal effect and low in vitro toxicity are presented, which represents an advance in the pre-clinical process of development and research of new antifungal agents.
- PublicaciónAcceso abiertoActividad antimicrobiana de hongos endófitos de plantas medicinales Mammea americana (Calophyllaceae) y Moringa Oleífera (Moringaceae).(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-06-26) Mosquera Rivera, Wilmer G.; Guerra Sierra, Beatriz Elena; Criado Guerrero, Libeth-YajairaLas enfermedades infecciosas, son la causa principal de muertes en el mundo. En la actualidad, un factor preocupante, es el aumento de la resistencia bacteriana a los antibióticos, siendo esto un problema de salud pública. La Organización Mundial de la Salud (OMS) priorizó la investigación de nuevos antibióticos para el tratamiento de los patógenos multiresistentes. Por tal motivo es necesaria una búsqueda de nuevos nichos y hábitats de agentes antimicrobianos potencialmente eficaces. Siendo asi se evaluó la actividad antimicrobiana de los hongos endófitos de Mammea americana y Moringa Oleífera en Staphylococcus aureus (ATCC® 29213™) y Escherichia coli (ATCC® 25922™).Se llevó a cabo una metodología según un estudio experimental en 60 muestras vegetales. Se aislaron e identificaron hongos endófitos, se les evaluó su actividad antimicrobiana mediante ensayo dual in vitro a través de la presencia de halos de sensibilidad, posteriormente se realizaron recopilaciones continuas de biomasa de los endófitos para obtener extractos de las moléculas bioactivas, a las cuales se les midió la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI ), concentración mínima bactericida (CMB) y citotoxicidad. Las pruebas de antagonismo y sensibilidad in vitro, permitieron preseleccionar 14 hongos con actividad antimicrobiana, de la clase Ascomycete y Deuteromycete, aislados en mayor proporción de semillas y hojas. La mayoría de sus extractos presentaron inhibición tanto de las cepas sensibles como de las resistentes para las dos bacterias. Considerando los resultados de las CMI, CMB y citotoxicidad, se demostró que los hongos endófitos poseen características bactericidas sin ocasionar daño alguno. Las pruebas de sensibilidad in vitro permitieron seleccionar y conocer los endófitos con posibles metabolitos secundarios con propiedades antimicrobianas y no tóxicas, por esta razón los hallazgos encontrados son importantes para continuar con investigaciones sobre los mecanismos de acción, resaltando que el aislamiento de endófitos en estas plantas es escaso o desconocido
- PublicaciónAcceso abiertoFactores asociados a la infestación de las viviendas por Aedes spp. En dos localidades mexicanas con transmisión endémica de dengue(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-03-22) Monroy Díaz, Ángela L.; Martínez Vega, Ruth Aralí; Ramos Castañeda, JoséEl dengue es una de las principales Enfermedades Transmitidas por Vectores (ETV) y es un problema de salud pública a nivel mundial debido a su morbilidad y mortalidad. En México, es de alta endemia a pesar de las múltiples acciones de control utilizadas, lo cual fomenta el desarrollo de investigaciones que guíen a un control vectorial exitoso. El objetivo de este trabajo fue determinar los factores asociados a la infestación de la vivienda por Aedes spp. en dos localidades mexicanas. Materiales y métodos: Se realizó un análisis secundario de un estudio de cohorte con una encuesta de los factores entomológicos y sociodemográficos a una persona mayor de edad que vive en la casa y la inspección del patio y jardín correspondientes. La encuesta se aplicó cinco veces cada seis meses. Se determinaron índices Aedicos, además se evaluó la relación entre la infestación y las variables independientes mediante un análisis multinivel determinando los OR mediante una regresión logística binomial. Resultados El índice de Breteau mas alto fue 32, obtenido durante la primera evaluación además el índice de casa presentó un 29.3% en la última evaluación. En cuanto a las condiciones de la vivienda, se observó que la mayoría de los desagües estaban conectados a la red pública (Hasta 93.2%), los contenedores con los porcentajes más altos de infestación eran los tambos (Barriles de Agua) y el lavadero de ropa o pila con valores entre 20 y 55%. Los factores asociados con la infestación por Aedes fueron, el mantenimiento de la casa, el patio y el jardín, así como la cantidad de sombra en el patio. Conclusiones: Los resultados obtenidos muestran que, a pesar de las actividades antivectoriales, el objetivo de reducir la proliferación de Aedes no se ha alcanzado completamente.
- PublicaciónAcceso abiertoActividad antibacteriana y citotóxica de bioconjugados de péptidos Ib-M con nanopartículas de óxido de hierro contra Escherichia coli O157:H7 y células vero(2019-06-14) Prada Prada, Sergio Alfonso; Hernández Peñaranda, Indira PaolaEscherichia coli O157:H7 es el patógeno más común aislado en brotes relacionados con alimentos cárnicos, está directamente asociado con el desarrollo del Síndrome Hemolítico Urémico (SHU) y posee gran capacidad para desarrollar resistencia antimicrobiana. Péptidos Ib-M son análogos de Ib-AMP4 (Derivados de Impatiens balsamina) y han mostrado actividad contra E. coli no patógena. Los péptidos suelen ser susceptibles a ser degradados rápidamente en entornos fisiológicos; el uso de nanopartículas de óxido de hierro recubiertas con quitosano (NpOH@Qui) como moléculas transportadoras los protege del efecto de las proteasas y sus propiedades magnéticas los dirige con mayor especificidad a los órganos blanco. En este estudio se evaluó la actividad contra E. coli O157:H7 y su citotoxicidad en células VERO de péptidos Ib-M y del bioconjugado de péptido Ib-M con nanopartículas de óxido de hierro recubiertas con quitosano (IbM/NpOH@Qui). Para ello, la actividad antibacteriana de los péptidos Ib-M y de IbM/NpOH@Qui se obtuvo al determinar la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI), Concentración Mínima Bactericida (CMB), Cinética de Crecimiento y Letalidad. El efecto citotóxico de los compuestos se evaluó por MTT y posteriormente se calculó la Concentración Citotóxica 50 (CC50) e índices de selectividad (IS). La CMI de péptidos Ib-M se obtuvo en un rango de 1,6 a 12,5 μM y la CMB de 3,7 a 22,9μM. Células VERO en presencia de péptidos Ib-M mostraron CC50 en un rango de 197,5 a >400 μM. Ib-M1 fue el péptido seleccionado para ser inmovilizado en la NpOH@Qui. El bioconjugado IbM/NpOH@Qui obtuvo una CMI de 12,5 μM contra E. coli O157:H7 y en células VERO una CC50 >25 μM (357 μg/Ml NpOH@Qui). Los péptidos libres y el bioconjugado presentaron actividad in vitro contra E. coli O157:H7. El Bioconjugado se considera un nanotransportador promisorio que una vez sea perfeccionado podría ser llevado a ensayos de experimentación in vivo.
- PublicaciónAcceso abiertoEfecto antibacteriano de una nanoemulsión de ftalocianina de aluminio clorada sobre periodontopatógenos relevantes en el paciente diabético tipo 2: Estudio in vitro(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-09-16) Lloreda Rey, Laura-Patricia; Herrera Sandoval, Laura-Viviana; Méndez Díaz, Luz-Mery; Leal Pinto, Sandra-MilenaLa enfermedad periodontal (EP) y la diabetes mellitus (DM) son enfermedades crónicas con una relación bidireccional. El tratamiento convencional para la EP es altamente invasivo, consiste en la remoción mecánica de agentes microbianos de las superficies dentales. Investigaciones han propuesto el uso de la terapia fotodinámica (TFD) como modalidad terapéutica prometedora para el manejo de infecciones de la cavidad bucal. En este sentido, el objeto general fue determinar el efecto antimicrobiano in vitro de una nanoemulsión de Ftalocianina de Aluminio Clorada (NE-PcAlCl ) en combinación con la terapia fotodinámica sobre el crecimiento de periodontopatógenos prevalentes en la enfermedad periodontal del paciente diabético tipo 2. Metodológicamente, se evaluó el efecto antibacteriano de NE-PcAlCl y PcAlCl-libre contra Prevotella intermedia, Porphyromonas gingivalis y Aggregatibacter actinomycetemcomitans en condiciones de anaerobiosis mediante el método de microdilución. La actividad citotóxica fue evaluada en células Vero por el ensayo colorimétrico usando la sal de tetrazolio MTT. Para la TFD se utilizó una fuente de luz LED a 4.83 julios/cm2 por 2 minutos. Controles sin irradiación fueron probados bajo las mismas condiciones. Los resultados demostraron efecto antibacteriano de la NE-PcAlCl contra P. intermedia con CMI de 0,63 μM luego de la TFD, para el caso de P. gingivalis y A. actinomycetemcomitans no se encontró efecto de la NE-PcAlCl en las concentraciones evaluadas (> 20 μM) antes y después de la TFD. Por otro lado, la PcAlCl-libre y en nanoemulsión mostraron ser fototóxicas sobre células Vero (CC50 de 0,155 y 0,09 μM, respectivamente) sin registrar diferencias significativas entre ellas (p<0.05). En este sentido, los resultados obtenidos sugieren el potencial uso de la TFD en combinación con la NE-PcAlCl para la inhibición de P. intermedia, periodontopatógeno altamente prevalente en el paciente diabético tipo 2.
- PublicaciónAcceso abiertoFactores asociados a la incidencia de infección de sitio quirúrgico en una cohorte de usuarios del servicio de cirugía de un hospital de tercer nivel de atención en Bucaramanga, Colombia. 2017-2019(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-09-26) Rincón Guevara, Magda Katherinne; Aguilar Jiménez, Jhancy RocíoLa infección del sitio quirúrgico (ISQ) se constituye como la segunda Infección Asociada a la Atención en Salud (IAAS) más común en el mundo, representando hasta el 31% de todas las IAAS. Su incidencia constituye un índice eficaz en el control de calidad en la prestación de los servicios sanitarios de las instituciones de salud. El objetivo del estudio es determinar los factores asociados a ISQ en una cohorte de usuarios de cirugía con heridas limpias y limpias contaminadas en el Hospital Universitario de Bucaramanga Los Comuneros. Estudio observacional analítico de cohorte en 652 usuarios del servicio de cirugía de una institución de tercer nivel, en pacientes con heridas limpias y limpias contaminadas. Como variable principal se encuentra la ISQ y como variables independientes los factores preoperatorios, intraoperatorios y posoperatorios. Así mismo se determinó la incidencia acumulada y la tasa de incidencia de la ISQ. Se realizó un análisis bivariado y multivariado utilizando el modelo de regresión logística. Los datos fueron analizados en Stata 12.1 ®. Se encontró una incidencia acumulada correspondiente a 2,1%, presentándose 14 casos de ISQ, de los cuales el 64.2% fueron clasificados como infección incisional profunda. Así mismo, logró determinarse que factores como hipertensión arterial (OR39 IC95% 6.58-391.8), antecedente de diabetes mellitus (OR 9.99 IC95% 10.7-107.6), clasificación del ASA >3 (OR 9.53 IC95% 9.32-193.2), consumo de tabaco (OR 8.6 IC95% 1.95-17.1) y técnica quirúrgica inadecuada (OR 9.66 IC95% 3.94-48.1) se encontraron asociados a la incidencia de ISQ. Se evidenció subregistro de las cifras de incidencia de ISQ en la institución de salud. Se identificaron los factores de riesgo para la incidencia de la ISQ, los cuales, brindan información relevante para la implementación de acciones de prevención y el seguimiento del paciente, para la disminución del riesgo de la presencia de este evento adverso en la institución.