AD. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agropecuarias
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La Facultad nace luego de un extenso proceso que inició en 1999 cuando la Institución era aún una Corporación Universitaria, con la creación del Departamento de Ciencias Básicas, unidad que tenía como propósito ofrecer los cursos del área básica -biociencias, biología, química y bioquímica-, a los programas de la Facultad de Salud; posteriormente, se organiza el Departamento de Matemáticas y Física, con el objetivo de ofrecer los cursos en las áreas de matemática, física y estadística a los programas de las Facultades de Ingeniería, Administración y Salud.
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- PublicaciónAcceso abiertoActividad Antimicrobiana de Aceites Esenciales Derivados de Lippia alba Sobre los Odontopatógenos Candida albicans y Aggregatibacter actinomycetemcomitans(Universidad de Santander, 2021-11-26) Caicedo-Jiménez, Karen Alexandra; Guerra Sierra, Beatriz Elena; Quintero, Wendy LorenaEl presente estudio tuvo como objetivo evaluar la actividad antimicrobiana de aceites esenciales derivados de Lippia alba sobre Candida albicans y Aggregatibacter actinomycetemcomitans causantes de infecciones orales. Inicialmente, se evaluó la cinética de crecimiento de los microorganismos durante 48 h mediante espectrofotometría (600 nm), posteriormente se determinó la actividad antimicrobiana in vitro de aceites esenciales (AEs) derivados de L. alba y de sus terpenos bioactivos (óxido de cariofileno, citral y carvona) mediante microdilución en caldo (de forma individual y en combinación) y su actividad fungicida y bactericida. Los resultados fueron expresados como la concentración inhibitoria mínima (CIM) y el análisis estadístico se realizó mediante el uso del software (GraphPad Prism 5.0). Se encontró que los AEs del quimiotipo citral (F2 y F4) exhibieron la mejor actividad antimicrobiana (C. albicans: CIM 500μg/mL, concentración fungicida mínima (CFM) 1000 μg/mL; A. actinomycemtemcomitans: CIM 250 μg/mL y concentación bactericida mínima (CBM) 500 μg/mL; que las alcanzadas con los aceites del quimiotipo carvona y las referencias comerciales. Finalmente, los terpenos del quimiotipo citral (F2 y F4) evidenciaron la mejor interacción sinérgica in vitro contra la bacteria y (citral+OCN) para la levadura (CIF=0.41±0.11; μg/mL). Los resultados obtenidos representan una alternativa promisoria para el control de los microorganismos que causan la periodontitis.
- PublicaciónAcceso abiertoActualización de los conceptos asociados con la regeneración celular en plantas(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-01-24) Rueda Chacón, Natali; Chacón Velasco, Martha-RocíoIn a special edition of Science “what we don’t know?” dedicated to the 25 most important questions that scientists of all disciplines faced at the time, one of them was: “How does a single somatic cell from an adult plant?” the answer can be found in the theory of plant totipotency. This theory established that any somatic cell has the ability to regenerate into an adult plant. in contrast to this wildly accepted concept, recent research on plant regeneration has reported that: (i) cells that regenerate from an injured tissue don’t seem to have gone through dedifferentiation (ii) Callus are an organized and differentiated tissue, (iii) Callus don’t form from any type of somatic cell but predominantly, from a specific group of specialized adult stem cells. These results indicate that our view of plant regeneration needs a critical reanalysis. That is why there’s a need for a thorough review that allows the synthesis of the latest concepts related to plant regeneration, which could help give answers to fundamental questions of developmental plant biology. After an exhaustive review of the publications made in the last 18 years, it is possible to conclude that not all somatic cells are totipotent and that most of the process of regeneration on plants are carried away by meristematic stem cells and by a group of non-meristematic cells that have similar qualities to stem cells. The understanding of the molecular mechanisms through which plants regenerate is crucial for the advances of plant biotechnology. It is why the research that is done at a national and regional level, should not only take into account these new concepts but also contribute to the advances in this area of biotechnology.
- PublicaciónAcceso abiertoAislamiento e Identificación de Bacterias Nosocomiales, Procedentes de Ambiente y Superficies, de la Sala de Cirugía de la Clínica Veterinaria, Centro Especializado Maskotas(Universidad de Santander, 2022-12-05) Muñoz-Acosta, Sarah Camila; Delgado-Barragán, José Jair; Pinilla-León, Juan Carlos; Rocha-Muñoz, Linda PatriciaLa Clínica Veterinaria Centro Especializado Maskotas (CVCEM), ubicada en el municipio de Tunja del Departamento de Boyacá, con énfasis en la atención para pequeñas especies, ofrece servicios de Consulta Especializada, cirugía, Rx, Ecografía, Ortopedia, Estética, Guardería y Pet Shop. Teniendo como actividades más frecuentes las cirugías de ortopedia y de tejidos blandos, que se realizan en la sala de cirugía de la CVCEM. Es de vital importancia un protocolo de limpieza y desinfección dentro de la sala de cirugía, ya que es indispensable para evitar cualquier tipo de infección nosocomial que se pueda presentar dentro de esta zona y afectar la salud de los pacientes. Las infecciones nosocomiales se presentan con frecuencia en las salas de cirugía de las Clínicas Veterinarias, debido al mal manejo o falta de protocolos al momento de ingreso de cualquier intervención quirúrgica. El centro especializado Maskotas no cuenta con todos los protocolos requeridos para el manejo de todas las actividades realizadas en el quirófano, por este motivo el objetivo del presente documento de práctica empresarial, es aislar e identificar las bacterias nosocomiales de ambiente y superficies del quirófano, que puedan afectar el posoperatorio de los pacientes. Este aislamiento se realiza mediante pruebas de laboratorio, indicando el número de bacterias presentes en cada área evaluada. Dentro de los resultados durante el muestro # 1 en ambiente, la Staphylococcus aureus tiene una carga microbiana de 22 UFC/65cm2/ 1hora y de Coliformes Totales en la superficie de la mesa de instrumental: 35 UFC/cm2, la bacteria Pseudomona no reporto ninguna carga microbiana en ninguno de los casos del estudio. El procedimiento de limpieza y desinfección realizado en la sala de cirugía de la CVCEM posterior a un procedimiento quirúrgico, según los resultados arrojados; es efectivo, observando una reducción considerable de los microorganismos posterior a la realización de dicho procedimiento.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis de Factibilidad del Desarrollo de 4 Prototipos de Dulce Blando a Base de Leche Marca Dulcería Lucy(Universidad de Santander, 2021-07-19) Román Ramírez, Silvia Juliana; Osorio Márquez, Jorge-DanielEl presente proyecto aborda todo el tema referente a la producción del dulce de leche en la empresa Dulceria Lucy, en el municipio de Floridablanca. El dulce de leche hace parte de los productos tradicionales de los países Latinoamericanos, se pueden encontrar en el mercado dulces derivados de la leche de vaca entre los que se encuentran: las panelitas, cocadas de leche, manjar blanco y arequipe. El dulce de leche, es un producto derivado lácteo conseguido por concentración mediante calor, con la combinación de azúcares y otros ingredientes permitidos. El catálogo de producto que ofrece Dulceria Lucy solo se limita al dulce de leche, lo cual la deja atrás en cuanto a competitividad con los demás productos ofrecidos en el mercado. Este proyecto tiene como propósito ofrecer alternativas al limitado portafolio de productos de Dulcería Lucy, mediante la obtención de 4 prototipos de dulce blando a base de leche que sea innovador y que cumpla con las expectativas del cliente y con la normativa NTC 3757 del 2008 donde se establece los requisitos que debe cumplir el Dulce de leche para poder analizar la factibilidad del desarrollo de prototipos de dulce blandos a base de leche que permita a Dulcería Lucí una mejora.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis de la Germinación de Leucaena leucocephala spp. Post Tratamiento Hidrotérmico e Impregnación con Sábila, Sembrada en Sustrato Orgánico e Inerte(Universidad de Santander, 2022-11-10) Carreño-Correa, Rubén Darío; Villalba-Rey, Deicy; Borges-Peña, Rafael Eduardo; Camperos-Reyes, Jhonatan Eduardo; Grupo de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas para la Sostenibilidad CIBASLeucaena leucocephala es una forrajera con potencial en alimentación animal. Esta especie produce gran cantidad de semilla, sin embargo, presenta latencia, reduciendo la cantidad de semilla germinada y el número de plantas viables para trasplante. El sustrato de siembra, la implementación de técnicas de pregerminación y el uso de bioestimulantes son factores de interés en el proceso de germinación, por ello, la presente investigación implementó un experimento factorial 23 con el interés de establecer el efecto generado por el sustrato (orgánico convencional y espuma fenólica), la implementación o no de la técnica de pre-germinación hidrotermica y el uso o no de cristal de sábila A. vera con potencial enraizante sobre la germinación completa, brote hasta formación de nomófilas. Ante la no normalidad de la variable respuesta, se utilizaron el modelo logístico dicotómico y el análisis de supervivencia (tomando como variable respuesta la dupla tiempo de germinación y el evento germinó o no germinó) con los tres factores a evaluar como variables explicativas. Los resultados de estas técnicas concuerdan en establecer que la probabilidad de germinación de una semilla de L. leucocephala está asociada con la técnica de pre-germinación y el sustrato utilizado para la siembra, obteniendo los mejores resultados al someter la semilla a pre-germinación hidrotermica y sembrarla en sustrato orgánico convencional.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis de la Intensidad Sísmica Máxima Mediante la Teoría de Valores Extremos(2022-03-18) Perez-Alfonso, Jonathan; Rey-Villalba, DeicyEl objetivo de este estudio fue analizar el comportamiento sísmico de la región pacifica de Colombia. Para el desarrollo del estudio se incluyó magnitudes sísmicas locales de los departamentos de Chocó, Valle del Cauca, Cauca y Nariño entre los años 1993 y 2018. Mediante el uso de la teoría de valores extremos, se analizaron las magnitudes máximas en los eventos sísmicos ocurridos para obtener, así, modelos que describen el comportamiento de las observaciones por medio del método de bloques máximos y excedencias del umbral, que permiten asociar las magnitudes máximas de cada uno de los departamentos a un tipo de distribución como lo son : Gumbel, Weibull o Frechet, a partir de Distribución de Valores Generalizada o Beta , Exponencial o Pareto con uso de la Distribución de Pareto Generalizada. Los resultados obtenidos muestran niveles de retorno 5.08, 6.03, 6.88 y 7.24 para los periodos de retorno de 2, 10, 50 y 100 años respectivamente para el departamento de Chocó mediante el método de bloque máximo (Gumbel). De igual forma, a través del método de excedencias de umbral (Exponencial) , se estima que, en 100 años, pueden ocurrir terremotos en Chocó de magnitud igual o mayor a 7.2 en la escala de Richter.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis Estadístico de Franjas de Parada Transitorias en Intersecciones Semaforizadas para Motocicletas en Algunos Tramos Viales de Bucaramanga(2021-04-20) León, Francisco Javier; Pérez-Pulido, Miguel Oswaldo; Salas-Rondón, Miller HumbertoAccidentalidad Vial, Análisis Multivariante, Línea de Parada para Motocicleta, Índices de Accidentalidad, Modelos Para Datos de Conteo, Seguridad Vial. Descripción El objetivo fue analizar la accidentalidad vial en franjas de parada transitoria para motocicletas en intersecciones semaforizadas implementadas en 24 tramos y 168 intersecciones en Bucaramanga. Se desarrolló una investigación analítica, retrospectiva con elementos temporales. Se analizaron 6.230 accidentes clasificados en los periodos sin franja (2014 a 2016) y con franja (2017 a 2019). Las técnicas de análisis de datos empleados fueron: estadística descriptiva e inferencial, análisis de segmentación, análisis de correspondencias múltiples, modelos para datos de conteo y modelo de regresión logística. El software estadístico utilizado fue: SPSS (versión 25) y RStudio (versión 1.3.959). Resultados: La implantación de las franjas permitió una reducción de la accidentalidad total del 3,71%. Los tramos con mayor accidentalidad fueron Cra27 (20,66%), Cra15 (14,62%) y Cra33 (13,66%). Mostraron diferencias estadísticamente significativas con la Prueba de Wilcoxon el índice de severidad (p = ,02) en los tramos y Peligrosidad de Accidentes Totales (p = ,05) en intersecciones. La técnica de árboles de segmentación evidenció que el mayor porcentaje de la accidentalidad con heridos y víctimas fatales se presentó en el horario nocturno y estuvo involucrada una motocicleta. El análisis de correspondencias múltiple evidenció que los tres primeros ejes explicaron el 41,78% de la varianza acumulada. La encuesta de percepción vial mostró que el factor humano es el mayor causante de la accidentalidad (75,10%) seguido por la calidad de la señalización (65,70%). El modelo de regresión logística evidenció que conocer con qué fin se puso en práctica el plan piloto de las franjas aumenta la percepción de estar de acuerdo con su implementación. En conclusión, la accidentalidad vial es un fenómeno multifactorial, por ello se hace necesario emplear diferentes metodologías estadísticas para el seguimiento y verificar las medidas implementadas.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis estructural y determinación de la actividad tóxica de las mutantes 8cry11l553f, 8cry11l556w, y 8cry11l553f-l556w obtenidas por mutagénesis sitio dirigida en larvas de primer estadio de aedes aegypti.(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-11-23) Herrera Pineda, Diego Fernando; Suárez Barrera, Miguel Orlando; Rueda Forero, Nohora JulianaBacillus thuringiensis is a Gram-positive bacterium, δ-endotoxins producer that are toxic to different orders of insects and nematodes. Cry11 is a specific toxin against the vector A. aegypti, which is responsible for the transmission of dengue, zika and chikungunya; however, its mode of action and structure-function characteristics have not yet been fully elucidated. The research group of Molecular Biology and Biotechnology of the UDES, has a library obtained by shuffling the DNA of cry11 genes, highlighting the variant 8Cry11, which is 6 times more toxic than Cry11Aa and 3.8 more than Cry11Bb. Molecular Docking studies showed that positions 553 and 556 of this protein are relevant in the interaction with the cadherin receptor, to corroborate this information, site-directed mutagenesis was performed to reverse the aforementioned mutations, obtaining the variants 8Cry11L553F, 8Cry11L556W, and 8Cry11L553F-L556W. In this work, the toxic activity of mutants 8Cry11L553F, 8Cry11L556W, and 8Cry11L553F-L556W was determined, as well as an approximation of protein analysis both in silico and in vitro through SDS-PAGE. To achieve this, the ideal conditions for the production of δ-endotoxin (Cry11Aa) were standardized, finding a relationship between glucose concentrations (15g / L) and sources of organic and inorganic nitrogen in a ratio of 3: 7; the production of protoxin (~ 100 kDa) and toxin (32 and 34 kDa) was corroborated by SDS page. To determine the mean lethal concentration in comparison with the mutant 8Cry11 and the parental Cry11Aa, the toxicity of the mutants was evaluated, against first stage larvae of A. aegypti. The results showed loss of toxicity for the variants under study, which indicated that substituted amino acids in domain III were strongly possible involved in the loss of toxicity due to structural features.
- PublicaciónAcceso abiertoAporte Académico de la Universidad de Santander a sus Estudiantes a Través de la Comparación de las Pruebas de Estado Saber 11 - Saber Pro 2018(2022-06-16) Mojica-Perdomo, Adrian David; Pérez-Pulido, Miguel OswaldoEste trabajo presenta los resultados del estudio del aporte académico que realiza la Universidad de Santander, Colombia (UDES) a sus estudiantes en las competencias genéricas de Razonamiento Cuantitativo y Lectura Crítica de las pruebas Saber Pro 2018 al egresar de la institución con relación a los resultados en el Saber 11 al ingresar. Se realizó la estandarización de los puntajes en ambas pruebas con la finalidad de facilitar la interpretación de los resultados. La intención fue relacionar las variables AAMAT y AALECT con un conjunto de variables consideradas explicativas de las mismas como lo fueron: Género, Tipo de Colegio, Zona, Proyecto, Graduado, Tipo Estudiante, Programa, y Estrato, que en función de la literatura correspondiente se consideraron podían tener efecto sobre el AA. No obstante, se pudo determinar, que, para la muestra estudiada en esta investigación, no se encontró evidencia estadística de diferencia significativa entre las variables AAMAT y AALECT, y las variables explicativas; la única diferencia significativa resultó entre las variables AALECT y el Programa de Estudio, pero no mostró importancia significativa en los análisis. APORTE ACADÉMICO DE LA UNIVERSIDAD DE SANTANDER 12 Los resultados del ACC mostraron una correlación significativa entre las variables AAMAT y AALECT respecto a las variables edad y promedio, pero muy baja, del conjunto de entrada la variable con mayor correlación fue AAMAT, en tanto, del conjunto de salida la mayor correlación se encontró en la variable edad, esto permite determinar que el AA que hace la UDES se centra en el campo cuantitativo.
- PublicaciónAcceso abiertoAvances en Metodologías Para la Detección de Aflatoxinas en Granos en Almacenamiento(Universidad de Santander, 2023-01-24) Saldaña-Cabrales, Miguel Fernando; León, Francisco Javier; Novoa-Lizarazo, Leidy Viviana; Chacín-Zambrano, Christian AndreiLas micotoxinas producidas por hongos presentes en los productos agroalimentarios como los granos son asociadas en gran medida a la aparición de enfermedades que afectan la salud pública, siendo de importancia implementar métodos de detección. En ese sentido, este trabajo se centró investigar avances acerca de las metodologías para la detección de aflatoxinas. Para lograrlo se realizó una búsqueda sistemática de la información en la base de datos Scopus, aplicando un ajuste a los pasos del flujo de trabajo de la cartografía científica propuesta por (Cobo et al., 2012) para posteriormente ajustar los resultados según lo propuesto por (Beltrán-Arismendi, 2020). El empleo de herramientas bibliográficas y análisis de redes como Mendeley, VOSviewer, SciMAT y Gephi permitieron identificar 330 documentos entre artículos, revisiones, ponencias y libros, y con base a ello se encontró gran número de métodos aplicables (42 métodos) que se podrían implementar a futuro en Colombia dado a su sensibilidad, especificidad, costo de operación e infraestructura. Se evidencio que los métodos biológicos son los más adecuados para la identificación de aflatoxinas en muestras de granos a nivel mundial, siendo específicos y sensibles, simples en el proceso de manipulación de la muestra, rápidos y más económicos que los químicos y físicos. Y finalmente se recomienda seguir investigando en otras micotoxinas y así encontrar puntos convergentes sobre los métodos de detección para ser implementados en Colombia.
- PublicaciónAcceso abiertoBioconversión de Residuos Agrícolas por Micelio Fúngico Para la Elaboración de Prototipos de Bioproductos(Universidad de Santander, 2023-09-15) Caicedo-Jiménez, Nazly Julieth; Guerra-Sierra, Beatriz Elena; Ortíz-Meneses, Fredy Alejandro; Contreras-Contreras,Sandra Lorena; Grupo microbiotaDiferentes residuos generados por la industria son vertidos diariamente al ambiente en cantidades desmesuradas, impactando negativamente la calidad de vida, el ambiente y la sostenibilidad en el planeta. Un ejemplo es el poliestireno expandido o icopor, utilizado ampliamente a nivel global como material de empaquetado y construcción entre otros usos. Este material ocasiona alta contaminación, debido al espacio ocupado en los vertederos y su difícil degradación. Por lo tanto, el propósito de este trabajo fue generar un bioproducto para mitigar la creciente contaminación por poliestireno, aprovechando el potencial que ofrecen los diversos residuos postcosecha derivados de la agricultura Colombiana, para ser utilizados como sustratos en los procesos de bioconversión enzimática por G. lucidum y P. ostreatus , macromicetos reconocidos por la producción de enzimas hidrolíticas y oxidativas tales como lacasas, peroxidasas de manganeso y peroxidasas de lignina, hemicelulasas, entre otras. Para este propósito se realizaron diferentes tratamientos o mezclas en partes iguales de residuos de la caña (bagazo) cacota de cacao, cascara de Sacha inchi, aserrín y una fuente de nitrógeno, como sustratos de fácil adquisición y bajo costo en los que se desarrollaron los micelios de los macromicetos para su bioconversión bajo un sistema estandarizado de humedad, CO2, y temperatura. En este trabajo se obtuvo un bioproducto con características físico-mecánicas similares al poliestireno expandido, sugiriendo continuar con los ensayos en el grupo de investigación para optimizar las características de resistencia otorgadas por las diferentes formulaciones de residuos agrícolas, que son una fuente disponible, de bajo costo, biodegradables que sirven como sustrato para la elaboración de bioproductos sostenibles y amigables con el medio ambiente.
- PublicaciónAcceso abiertoBiodegradación de fenol en medio acuoso utilizando bacterias doblemente encapsuladas en matrices de polivinil-alcohol alginato y sílice(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-12-11) Carvajal Torres, Paula Alejandra; Valdivieso Quintero, Wilfredo; Flórez Castillo, Johanna-MarcelaDue to environmental requirements, the treatment of water from industrial processes has become a priority and under this premise phenol has served as a model compound to test new treatment processes mainly because it is a molecule that represents a family of chemical compounds with high toxicity and known and also these compounds are produced by many important industrial processes such as the oil, pharmaceutical, food industry, among others. Many processes have been tested to reduce the amount of phenols in water, but it has been found over the years that biodegradation is the simplest, most economical and easiest application process for the large volumes of industrial water produced. The objective of this research was to evaluate the biodegradation of phenol in aqueous medium by double-encapsulated bacteria in PVA-Alg and silica matrices. Different ratios of PVA and Alg and sodium and ludox® silicate were evaluated to find the best matrix for the study of phenol biodegradation. Likewise, a microorganism with the ability to degrade hydrocarbons was isolated. The results obtained allowed us to show that the best PVA-Alg matrix was P4-A1, since it presented the best results in the feasibility, shape, size and stability tests. It was found that the best matrix of sodium and ludox® silicate was S1-L5 because it presented, possibly a smaller pore size compared to the other matrices evaluated. Finally, regarding the biodegradation test, it was found that the phenol removal capacity by the free-isolated and encapsulated microorganism in the P4-A1 matrix was greater than the phenol removal capacity by Pseudomonas putida ATCC 49128 with 12 and 14% removal by the isolated microorganism and 7 and 10% by Pseudomonas putida ATCC 49128.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización de la diversidad microbiana cultivable, asociada al residuo lignocelulósico del proceso de beneficio de la hoja fique (Furcraea Andina) en Mogotes, Santander.(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-07-26) Vargas Gutiérrez, María Paula; Pinilla Corzo, RigobertoThe purpose of the present study was to contribute to the recognition of the diversity of microorganisms present in the residue lignocellulosic from the process of benefit of the sisal leaf Furcraea andina, the samples were taken at the experimental farm Jose Exelino Moreno, located in the municipality of Mogotes, Santander. The isolation of the culturable microorganisms was given through the use of specific culture media, after performing serial dilutions up to 10-6, later the microbial groups associated whit this residue were established by means of morphological keys and biochemical tests and finally the abundance of microorganisms were determined for each of the samples collected. We obtained a total of 55 isolates correpondian to 36 bacteria, 6 fungi and 13 yeast. In the macroscopic and microscopic characterization, 20 bacteria were selected 70% of the bacteria were Gram negatives and 30% Gram positive. Subsequently whit biochemical tests it could be deduced that there may be the presence of the family Enterobacteriaceae and of the genera Pseudomonas sp. and Bacillus sp. In the same way for the fungi, 7 isolates were selected, of which according to the technique of micro-culture and the taxonomic keys, one finds in greater proportion the genus Penicillium sp.. Finally, we selected 8 isolates of yeast, which according to the results obtained in the API 20 AUX, is the presence of two microorganisms of industrial interest Candida famata y Rhodotorula glutinis, the other yeasts according to the literature are reported as pathogenic for humans. Finally, the isoletes characterized were retained for the purpose of maintaining this biological material in a viable and stable state by method tube whit angle agar in mineral oil.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización de la Diversidad Microbiana de Suelos Destinados a Cultivos de Ananas comosus (piña), Tratados con Distintos Plaguicidas en el Municipio de Lebrija, Santander(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2021, 2021-05-06) Bravo Granados, Natalia Andrea; Rueda Forero, Nohora Juliana; Suárez Barrera, Miguel OrlandoEl suelo es un hábitat diverso, su composición varía dependiendo del uso, condiciones climáticas y actividades antropogénicas; y conocer los microorganismos presentes requiere la implementación de herramientas de secuenciación de nueva generación. Ananás comosus es un cultivo de gran importancia para Santander, sin embargo, los estudios referentes a la caracterización biológica del suelo asociado, son escasas en la región y en el país. En ese sentido, este trabajo se centró en la caracterización microbiana del suelo destinado a un cultivo de piña. Para lograrlo, las muestras se tomaron aleatoriamente de cuatro lotes a 20 cm de profundidad, obteniendo un total de 14 muestras. Se estandarizó el protocolo de extracción de ADN genómico total de suelo y la cantidad de ADN de cada muestra fue >60 ng/μl. Posteriormente se enviaron a secuenciar a MacroGen mediante la plataforma Illumina MiSeq (2x300 pb), obteniéndose un total de 1’518.101 secuencias de las muestras analizadas. El empleo de herramientas metagenómicas como el FASTQC y el MG-RAST, permitieron establecer la calidad de las secuencias obtenidas y la clasificación desde dominio hasta género de los microorganismos presentes en los suelos estudiados. Filo como Actinobacteria (>50%), Acidobacteria (>18%), Firmicutes (>16%) y Verrumicrobia (>10%), se encontraron con mayor predominancia entre las 14 muestras estudiadas. A nivel de género se encontraron en abundancia Candidatus Koribacter, Streptomyces, Isosphaera, Bacillus, Candidatus Solibacter y Actinomadura. Con respecto a la diversidad α, esta varía por las condiciones nutricionales del suelo, es por esto que en la muestra del suelo Blanco los valores de esta diversidad son los más bajos. Finalmente, se evidenció elevada similitud entre la composición de las comunidades microbianas de los cuatro suelos en estudio, indicando que el plaguicida y el bioplaguicida, no tienen un efecto significativo en la composición de la población microbiana presentes en la rizosfera del cultivo de piña.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización de la Microbiocenosis Asociada al Deterioro en Edificaciones Antiguas y Posibles Bienes de Interés Cultural en el área Metropolitana de Bucaramanga: una Aproximación Metagenómica(Universidad de Santander, 2023-07-07) Garcés-Manosalva, Rubén Darío; Rueda-Forero, Nohora Juliana; Herrera-Pineda, Diego Fernando; Valdivieso-Quintero, Wilfredo; Mantilla-Paredes, Andrea JulianaEl presente Trabajo de Grado tuvo como objetivo principal caracterizar la microbiocenosis asociada al biodeterioro en edificaciones antiguas y posibles bienes de interés cultural en el área metropolitana de Bucaramanga. Para llevar a cabo este análisis microbiológico, se utilizó el Laboratorio de Biología Molecular y Biotecnología de la Universidad de Santander UDES. El muestreo se realizó en la Casa de la Cultura Piedra del Sol, ubicada en Floridablanca, Santander. Se empleó la plataforma MG-RAST para lograr una identificación precisa de los microorganismos hasta nivel de género. Esta identificación se basó en el uso de metadatos detallados que proporcionaban información esencial sobre la muestra analizada, los objetivos del estudio, el lugar exacto de recolección, el tipo de librería utilizada y los genes y regiones secuenciadas. Los análisis se llevaron a cabo mediante el uso de algoritmos basados en similaridad, lo que permitió realizar asignaciones taxonómicas precisas. La concentración de ADN obtenida en el análisis fue de 500 ng/µL. En términos generales, se puede concluir que el biodeterioro que afecta los materiales que forman parte del ecosistema de un bien cultural se define como el proceso en el cual las actividades vitales de los organismos resultan en cambios indeseables en las propiedades de dicho material. Gran parte de la microbiocenosis descrita en este estudio son conocidos por su capacidad de deteriorar diversos materiales entre ellos el concreto. Es importante destacar que en esta investigación se obtuvieron datos veraces y precisos, lo que indica que el proceso de secuenciación se llevó a cabo de manera satisfactoria.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización de nuevas proteínas Cry11 obtenidas por modelos heurísticos computacionales(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2018, 2018-11-23) Abaunza Villamizar, Sebastián Mauricio; Suárez Barrera, Miguel OrlandoBacillus thuringiensis (Bt) is a Gram positive bacterium with parasporal inclusion bodies, also called δ-endotoxins, within these is the Cry protein that is known for its toxic activity against multiple orders of insects and nematodes, the vector-borne diseases A. aegypti, it transmites several important diseases in public health such as Dengue, Zika Chikungunya, among others. Cry11 has been recognized for its high specificity against A. aegypti. However, the emergence of resistance by insects that are the object of study, have resulted in the application of various strategies, for the improvement of proteins including site-directed mutagenesis and DNA shuffling. The use of biocomputational tools has expanded the spectrum in the development of molecules with greater potential, however, these strategies have not been described in the development of enhanced mutants of Cry. This work is based on the use of software HIDDEN 1.0 where libraries of in silico variants were obtained from Cry11Aa. Heu2, Heu3 and Heu4 variants were selected, and validated in vitro, they were synthesized, cloned into PSV2 and were expressed in E.coli DE3BL21 and B. thuringiensis BMB171, their electrophoretic profiles were analyzed in SDS-Page and their toxicity activity was evaluated by thick tests with A. aegypti. Parallel to this a structural analysis with matrix of MatGat, Bioedit and structural comparisons were contrasted with the literature. It was found that the variants presented an upper identity more than 97% with Cry11Aa, the changes mostly belonged to domain II, and their lethality percentages were less than 5%, which suggests that the amino acid changes in the important regions of the three domains are involved in the toxicity activity demonstrated by the proteins.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización del efecto de mezclas de terpenos derivados de aceites esenciales de Lippia alba y agentes quimioterapéuticos sobre células de cáncer hematológico(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2020, 2020-03-13) Vargas Munévar, Laura Camila; Moreno Moreno, Erika MarcelaEl cáncer constituye la segunda causa de muerte a nivel mundial, siendo las leucemias el tipo de cáncer hematológico más representativo en niños y adultos, con una cifra aproximada de 309.006 defunciones y 437.033 nuevos diagnósticos. Actualmente, el tratamiento de estas neoplasias se caracteriza por ser altamente tóxico, con desenlace en múltiples y graves efectos colaterales. Por tanto, el desarrollo de terapias farmacológicas basadas en moléculas bioactivas de plantas es prometedor teniendo en cuenta sus propiedades antiproliferativas y baja toxicidad. En este contexto, este trabajo caracterizó el efecto de mezclas de terpenos, derivados de aceites esenciales de Lippia alba, limoneno y citral, con los medicamentos oncológicos citarabina y doxorrubicina. Los resultados obtenidos de las interacciones farmacológicas fueron expresados por medio de isobologramas de radio fijo y la detección de cambios morfológicos y de potencial de membrana mitocondrial fue llevado a cabo por medio de microscopía óptica y de fluorescencia, respectivamente. En este trabajo, se encontró que en células de LMA la combinación con mejor perfil fue limoneno+citarabina (ΣCIF=0,27), demostrando además efecto antagónico (protector) sobre el linaje no tumoral (ΣCIF=1,15). Por otra parte, en células de LMC, la mejor interacción fue limoneno+citral (ΣCIF=0,46); sin embargo, es importante destacar que la mezcla citral+doxorrubicina, representó la segunda combinación de mayor eficacia (ΣCIF=0,54) y, además, evidenció un efecto antagonista sobre las células Vero (ΣCIF =1,18). En todas las combinaciones testadas se evidenciaron cambios morfológicos posiblemente de tipo apoptótico. Estos resultados permiten sugerir que las moléculas bioactivas podrían ser utilizadas como coadyuvantes de la terapia convencional, potencializando su efecto antiproliferativo de manera selectiva contra células de la LMA y LMC.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización microbiológica de lodos de tres estaciones de lavaderos de autos del área metropolitana de Santander(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-12-19) Lopera Murillo, Doris J.; Parra Aparicio, Gina-PatriciaThe present study proposes the microbiological characterization of sludge from three car wash stations in the municipalities of Piedecuesta, Floridablanca and Girón in the department of Santander. The objective of this project is to identify the microbial load: Fecal coliforms, Salmonella sp., Helminth eggs and enteric viruses, in sludge generated in the car washes of Piedecuesta, Floridablanca and Girón. Four methodologies were applied to carry out this research. For Salmonella sp. The Horizontal Method of NTC 4574 was followed, for the detection of Coliforms the Horizontal Method of NTC 4458/07 was followed; for the detection of phages the guidelines of the Standard Methods of 2018 were followed and finally for the helminth eggs, the Official Mexican Norm NOM-004-ECOL2000 was followed; After the analysis, it was detected that 40.74% of the samples comply with the parameters established by Decree 1287 of 2014, since they were classified in category A. The opposite happened with 59.25% of the remaining samples, which were classified in category B.
- PublicaciónAcceso abiertoComparación de dos inductores de la ovulación en un programa de IATF con semen sexado en ganadería de ceba(2020-06-03) Toro García, Diana Carolina; Vega Borda, Diego-Armando; Narváez Bedoya, Héctor-JavierLa inseminación artificial es la técnica más utilizada para mejorar la producción ganadera, pues promueve el mejoramiento genético y el desarrollo económico del hato. Colombia es un país rezagado en la implementación de biotecnologías; uno de las pocas técnicas de uso por la ganadería nacional es la inseminación artificial a tiempo fijo (IATF). Esta técnica es sensible al uso de inductores de la ovulación, usados para incrementar las tasas de preñez y que se puede complementar con el uso de semen sexado. En cuanto a la literatura, es bajo el número de publicaciones que asocie agrupamiento de estros y tasas de preñez. Estas características pueden ser reguladas por inductores de la ovulación como el Benzoato de Estradiol (BE) y Cipionato de Estradiol (ECP). Los estrógenos BE y ECP pueden regular el pico ovulatorio que genera la LH que lleva a la dehiscencia del folículo y la salida del ovocito. Esta investigación compara la eficiencia del BE y ECP usados como inductores de la ovulación en un programa IATF con semen sexado en ganado Brahman Rojo por Senepol. Los datos utilizados se obtuvieron a partir de un diseño experimental aleatorio, incorporando los dos tratamientos (BE, ECP) con 5 repeticiones. Los datos se procesaron con la prueba de Tukey (p = 5%). Se compararon tamaño de los folículos (10.81mm ± 2.08mm para BE y 11,48mm ± 2.88mm para ECP) con p>0.05 (diferencia no significativa) y tasas de preñez (36% para BE y 54% para ECP) con p>0.05 (diferencia no significativa). Se concluye que el uso de los dos tratamientos no difiere de manera significativa.
- PublicaciónAcceso abiertoComparación Entre Cinco Técnicas Coprológicas para el Diagnóstico de Laboratorio de Quistes de Balantidium coli en Muestras Fecales de Cerdos(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2020, 2020-12-11) Becerra Arias, Viviana; Pinilla León, Juan CarlosBalantidium coli hace parte del grupo de protozoarios ciliados y es el único miembro de la familia Balantidiidae capaz de afectar a los humanos llegando a comprometer gravemente su salud. Para la recuperación de B. coli de materia fecal se debe tener en cuenta el estadio en que se encuentra el parásito, pero, no hay una técnica coprológica estandarizada que garantice el correcto diagnóstico. Este trabajo tiene como objetivo determinar la concordancia de cinco técnicas coprológicas en el diagnóstico de quistes de B. coli en muestras fecales de cerdos de granjas traspatio del área metropolitana de Bucaramanga. Se realizó un estudio de corte transversal en el que se implementaron cinco técnicas coprológicas (centrifugación-flotación, McMaster, examen directo con lugol y solución salina 0,87% y tinción de Ziehl-Neelsen) a 279 muestras fecales de cerdos de criaderos traspatio, previo consentimiento del propietario. Se utilizó el índice Kappa para determinar la concordancia entre las técnicas. Entre las técnicas utilizadas, el examen directo con Lugol mostró la mayor recuperación recuperación de quistes de B. coli con 52.7%, seguido del examen directo con solución salina al 0.87% con un 37.6% de muestras positivas. La concordancia entre las técnicas mostró un coeficiente kappa estadísticamente significativo para los exámenes directos realizados con lugol y solución salina al 0,87% (k=0.41). Conclusiones: Las técnicas coprológicas que mostraron mayor eficiencia para recuperar quistes de B. coli fueron las directas, siendo la solución de Lugol la que permitió mayor captación del diagnóstico frente a la solución salina al 0,87%. Además, la concordancia entre estas dos técnicas mostró un acuerdo moderado, lo que demuestra que realizar ambas técnicas puede mejorar la detección del parásito.