ADBA. Trabajos de grado

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    Acceso abierto
    Caracterización de la Microbiocenosis Asociada al Deterioro en Edificaciones Antiguas y Posibles Bienes de Interés Cultural en el área Metropolitana de Bucaramanga: una Aproximación Metagenómica
    (Universidad de Santander, 2023-07-07) Garcés-Manosalva, Rubén Darío; Rueda-Forero, Nohora Juliana; Herrera-Pineda, Diego Fernando; Valdivieso-Quintero, Wilfredo; Mantilla-Paredes, Andrea Juliana
    El presente Trabajo de Grado tuvo como objetivo principal caracterizar la microbiocenosis asociada al biodeterioro en edificaciones antiguas y posibles bienes de interés cultural en el área metropolitana de Bucaramanga. Para llevar a cabo este análisis microbiológico, se utilizó el Laboratorio de Biología Molecular y Biotecnología de la Universidad de Santander UDES. El muestreo se realizó en la Casa de la Cultura Piedra del Sol, ubicada en Floridablanca, Santander. Se empleó la plataforma MG-RAST para lograr una identificación precisa de los microorganismos hasta nivel de género. Esta identificación se basó en el uso de metadatos detallados que proporcionaban información esencial sobre la muestra analizada, los objetivos del estudio, el lugar exacto de recolección, el tipo de librería utilizada y los genes y regiones secuenciadas. Los análisis se llevaron a cabo mediante el uso de algoritmos basados en similaridad, lo que permitió realizar asignaciones taxonómicas precisas. La concentración de ADN obtenida en el análisis fue de 500 ng/µL. En términos generales, se puede concluir que el biodeterioro que afecta los materiales que forman parte del ecosistema de un bien cultural se define como el proceso en el cual las actividades vitales de los organismos resultan en cambios indeseables en las propiedades de dicho material. Gran parte de la microbiocenosis descrita en este estudio son conocidos por su capacidad de deteriorar diversos materiales entre ellos el concreto. Es importante destacar que en esta investigación se obtuvieron datos veraces y precisos, lo que indica que el proceso de secuenciación se llevó a cabo de manera satisfactoria.
  • Publicación
    Acceso abierto
    Evaluación de Cambios en la Abundancia del gen Codificante para la Enzima Catecol-2,3-dioxigenasa (catA) Durante el Proceso de Biodegradación de Asfaltenos en un Sistema in vitro
    (Universidad de Santander, 2023-07-27) Osorio-Acero, Juan Nicolás; Valdivieso-Quintero, Wilfredo; Osorio-Márquez, Jorge Daniel; Agualimpia-Valderrama, Bayron Enrique
    Una de las actividades de hoy en día que se encuentra en constante crecimiento es la exploración y explotación de hidrocarburos. El petróleo es la principal fuente energética y de comercio en la mayoría de los países. Según los informes de Ecopetrol, en Colombia se producen alrededor de 866.488 barriles diarios, de los que cerca del 42% son de crudo pesado. El crudo pesado, en su mayoría compuesto por asfaltenos, presentan daños perjudiciales al medio ambiente y a la biodiversidad en los ecosistemas. El objetivo de este estudio fue estudiar los cambios en la abundancia del gen catA de un consorcio microbiano conformado por Pseudomonas stutzeri, Rhodococcus corynebacterioides y Rhodococcus qingshengii, luego de la exposición a asfaltenos y petróleo crudo ligero. Para ello, se determinó los niveles de producción de CO2 por parte del consorcio bacteriano durante la biodegradación de asfaltenos y petróleo crudo ligero, con el fin de monitorear el crecimiento y la actividad metabólica del consorcio. Para esto, se realizó una extracción de ADNg total, al cual se realizó qPCR con el propósito de cuantificar los genes ARNr 16S y catA del consorcio microbiano en presencia de asfaltenos y petróleo crudo ligero. Por último, utilizando el método de Livak (2−𝐶𝑡) se estimó la abundancia relativa del gen catA durante la biodegradación de asfaltenos por parte del consorcio bacteriano. Los resultados sugieren que la actividad metabólica del consorcio y los cambios del gen catA son independientes a la cantidad de copias del gen ARNr 16S. En conclusión, se evidenció una mayor abundancia relativa del gen catA en el tratamiento con asfaltenos en comparación con el tratamiento con petróleo crudo ligero.
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    Acceso abierto
    Potencial Cardioprotector de Encapsulados Polifenólicos de Theobroma cacao L. Sobre un Modelo In Vitro de Cardiotoxicidad Inducido por Doxorrubicina
    (Universidad de Santander, 2023-07-19) Paez-Lizcano, Silvia Catalina; Uceda-Castellanos, Leidy Marcela; García-Sánchez, Liliana Torcoroma; Hernández, Indira Paola; Rueda-Forero, Nohora Juliana; Biotecnología Agroambiental y Salud - MICROBIOTA; Manejo Clínico - CLINIUDES
    Antecedentes: El cáncer es considerado un desafío global de salud pública y una de las principales causas de muerte, a nivel global. Los tratamientos convencionales se basan en el uso de quimioterápicos como Doxorrubicina (Dox), que ocasionan gran variedad de efectos adversos, principalmente de tipo cardiotóxico. Así, es importante el estudio de terapias complementarias con capacidad cardioprotectora. Al respecto, polifenoles derivados de Theobroma cacao L han sido descritos como potentes antioxidantes, antiinflamatorios y cardioprotectores. Métodos: Extractos polifenólicos de semillas de clones de T. cacao L [CCN51 (A16-160) e ICS-95 (ICS-95)] fueron deshidratados mediante spray dryer y liofilización respectivamente; y encapsulados en goma arábiga al 16%. Ensayos de citotoxicidad de los encapsulados y de interacción farmacológica, en combinación con Dox, fueron realizados sobre células de miocardioblastos murinos H9c2. Técnicas de microscopía óptica y de fluorescencia fueron usadas para estimar los efectos sobre la integridad celular, el potencial de membrana mitocondrial y el estrés oxidativo. Resultados: Las terapias individuales con encapsulados de T. cacao L demostraron muy baja toxicidad sobre células H9c2 (CC50 A16-160=4.709 ± 2,0 µg/mL; CC50 ICS-95=1.916 ± 4,0 µg/mL), en comparación con Dox (CC50 10,3 ± 0,6 µg/mL). No obstante, su uso combinado con Dox presentó comportamiento sinergístico sobre H9c2, incrementando la toxicidad del quimioterapéutico [Dox+A16-160 (∑CIF= 0,4 ± 0,14) y Dox+ICS-95 (∑CIF= 0,5 ± 0,12)], a pesar de disminuir hasta cuatro veces su CC50. Igualmente, la mezcla de encapsulados de cacao con Dox incrementó la perturbación del potencial de membrana mitocondrial y el aumento de estrés oxidativo, sobre las células cardiacas. Conclusión: Los extractos polifenólicos de T. cacao L demostraron ser seguros sobre las células estudiadas, sin embargo, estudios posteriores de interacción farmacológica con Dox deben realizarse usando menores concentraciones, considerando su potencial antioxidante y cardioprotector.
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    Acceso abierto
    Bioconversión de Residuos Agrícolas por Micelio Fúngico Para la Elaboración de Prototipos de Bioproductos
    (Universidad de Santander, 2023-09-15) Caicedo-Jiménez, Nazly Julieth; Guerra-Sierra, Beatriz Elena; Ortíz-Meneses, Fredy Alejandro; Contreras-Contreras,Sandra Lorena; Grupo microbiota
    Diferentes residuos generados por la industria son vertidos diariamente al ambiente en cantidades desmesuradas, impactando negativamente la calidad de vida, el ambiente y la sostenibilidad en el planeta. Un ejemplo es el poliestireno expandido o icopor, utilizado ampliamente a nivel global como material de empaquetado y construcción entre otros usos. Este material ocasiona alta contaminación, debido al espacio ocupado en los vertederos y su difícil degradación. Por lo tanto, el propósito de este trabajo fue generar un bioproducto para mitigar la creciente contaminación por poliestireno, aprovechando el potencial que ofrecen los diversos residuos postcosecha derivados de la agricultura Colombiana, para ser utilizados como sustratos en los procesos de bioconversión enzimática por G. lucidum y P. ostreatus , macromicetos reconocidos por la producción de enzimas hidrolíticas y oxidativas tales como lacasas, peroxidasas de manganeso y peroxidasas de lignina, hemicelulasas, entre otras. Para este propósito se realizaron diferentes tratamientos o mezclas en partes iguales de residuos de la caña (bagazo) cacota de cacao, cascara de Sacha inchi, aserrín y una fuente de nitrógeno, como sustratos de fácil adquisición y bajo costo en los que se desarrollaron los micelios de los macromicetos para su bioconversión bajo un sistema estandarizado de humedad, CO2, y temperatura. En este trabajo se obtuvo un bioproducto con características físico-mecánicas similares al poliestireno expandido, sugiriendo continuar con los ensayos en el grupo de investigación para optimizar las características de resistencia otorgadas por las diferentes formulaciones de residuos agrícolas, que son una fuente disponible, de bajo costo, biodegradables que sirven como sustrato para la elaboración de bioproductos sostenibles y amigables con el medio ambiente.
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    Acceso abierto
    Diseño y Evaluación de Oligonucleótidos Para el Clonaje de un Fragmento de ADN Asociado con Lipasas Extracelulares de Candida palmioleophila en el Vector de Expresión pKLAC2
    (Universidad de Santander, 2023-09-16) Rojas-Pérez, Juan David; Valdivieso-Quintero, Wilfredo; Rueda-Forero, Nohora Juliana; Herrera-Pineda, Diego Fernando; Ciencias Básicas y Aplicadas para la Sostenibilidad – CIBAS
    La levadura Candida palmioleophila (C. palmioleophila) es un microorganismo con potencial para la producción de lipasas. Se ha investigado sobre los genes que codifican proteínas con actividad lipolítica en esta levadura, sin embargo, a la fecha se ha expresado solo uno que corresponde a una proteína de alrededor de 27 KDa. El objetivo del presente trabajo es diseñar oligonucleótidos que permitan la amplificación de una secuencia de ADN asociada con lipasas extracelulares de C. palmioleophila para su inserción en vectores de expresión. Para lograr esto, se realizó el diseño de oligonucleótidos que permitan la amplificación del fragmento de interés en este caso un segmento denominado Secuencia 8 (Sec8). Los oligonucleótidos se evaluaron para identificar la especificidad de la amplificación y luego ser usados para reacción en cadena de la polimerasa (RCP) convencional. Se observo una correcta amplificación permitiendo confirmar, que los oligonucleótidos diseñados eran funcionales, así mismo se dio una correcta escisión por parte de las enzimas en el plásmido y en la secuencia, sin embargo, no se logró evidenciar la inserción del fragmento amplificado en el vector de expresión. Aunque no se obtuvieron clones con la secuencia esperada, este trabajo permitió identificar que los oligonucleótidos diseñados permiten la amplificación del fragmento de ADN de la lipasa Seq8.