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dc.contributor.advisorFarfán García, Ana Elvira-
dc.contributor.authorJaraba Martínez, María Stephany-
dc.contributor.authorEscudero Sierra, Paula Remedios-
dc.contributor.authorPrada Aparicio, Luis Carlos-
dc.date.accessioned2020-02-12T20:56:54Z-
dc.date.available2020-02-12T20:56:54Z-
dc.date.issued2019-06-21-
dc.identifier.urihttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/4458-
dc.description71 pspa
dc.description.abstractEn los últimos años, la resistencia a antibióticos ha aumentado de manera exponencial provocando una gran problemática de salud pública a nivel mundial. Las bacterias han desarrollado diferentes mecanismos de resistencia para inhibir la acción de los antibióticos. Uno de éstos mecanismos son las bombas eflujo, las cuales tiene como función expulsar el fármaco del interior de la célula hacia el exterior para disminuir la toxicidad y evitar la muerte de la bacteria. Objetivo: Determinar la presencia de los genes de resistencia mdtK y tolC de la bomba de eflujo, en aislados clínicos pediátricos de Escherichia coli con patrones fenotípicos de resistencia a multidrogas. Metodología: En este estudio descriptivo, se incluyeron 66 aislados de E. coli con patrones fenotípicos de Sensibilidad, Sensibilidad Intermedia y Resistencia frente a Ciprofloxacina y Ácido Nalidíxico, en una población pediátrica de Bucaramanga y su área metropolitana. Se estandarizó una PCR convencional para la identificación de los genes tolC y mdtK. Posteriormente, 9 amplificados se seleccionaron por conveniencia para los estudios de secuenciación y análisis de mutaciones. Posteriormente, se utilizaron herramientas bioinformáticas para realizar el análisis de las secuencias obtenidas. Resultados: Se identificaron los genes mdtK y tolC en el 100% de los aislados analizados. En cuanto a los resultados bioinformáticos se evidenció homología en la expresión de la proteína ASJ42092.1 con el gen tolC y la proteína ASI16402.1 con el gen mdtK involucrados en el eflujo activo de quinolonas y fluoroquinolonas. Conclusiones: Se logró determinar la presencia de los genes tolC y mdtK en los aislados clínicos pediátricos, genes involucrados en el eflujo activo de quinolonas y fluoroquinolonas.spa
dc.description.tableofcontentsINTRODUCCIÓN .................................................................................................. 16 1. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA ............................................................ 18 2. JUSTIFICACIÓN ........................................................................................... 21 3. OBJETIVOS .................................................................................................. 24 3.1 OBJETIVO GENERAL ................................................................................... 24 3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS .......................................................................... 24 4. MARCO REFERENCIAL ............................................................................... 25 4.1 ESTADO DEL ARTE ................................................................................... 25 4.1.1 Asia ............................................................................................................. 26 4.1.2 África. .......................................................................................................... 26 4.1.3 Oceanía. ...................................................................................................... 27 4.1.4 Europa. ........................................................................................................ 27 4.1.5 Norteamérica. .............................................................................................. 29 4.1.6 Latinoamérica y el Caribe. ........................................................................... 29 4.2 MARCO CONCEPTUAL ................................................................................. 29 4.2.1. Biología y taxonomía de Escherichia coli.. .................................................. 29 4.2.2. Características clínicas. .............................................................................. 30 4.2.3. Resistencia antimicrobiana ......................................................................... 31 4.2.4. Clasificación de las bombas de eflujo ......................................................... 33 5. METODOLOGÍA ............................................................................................ 37 5.1 DISEÑO DEL ESTUDIO ................................................................................ 37 5.2 ÁREA DE ESTUDIO ...................................................................................... 37 5.3 UNIVERSO .................................................................................................... 37 5.4 POBLACIÓN .................................................................................................. 37 5.5 MATERIAL BIOLÓGICO ................................................................................ 38 5.6 EXTRACCIÓN DE ADN ................................................................................. 39 5.7 REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA - PCR ................................ 40 5.8 ELECTROFORESIS ..................................................................................... 41 5.9 SECUENCIACIÓN ........................................................................................ 41 5.10 ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO .................................................................... 41 5.11 ANÁLISIS DE RESULTADOS ...................................................................... 42 5.12 ASPECTOS ÉTICOS ................................................................................... 42 6. RESULTADOS .............................................................................................. 44 6.1 RESULTADOS DE LA AMPLIFICACIÓN DE LOS GENES tolC Y mdtK ......... 44 6.2 RESULTADOS ANÁLISIS BIOINFORMÁTICOS ............................................ 47 6.2.1 Ubicación del gen tolC en el Cromosoma de E. coli K12. ............................ 47 6.2.2 Vecindad topológica conservada del gen tolC.............................................. 48 6.2.3 Red interacción proteína – proteína TolC ..................................................... 49 6.2.4 Alineamiento de dominios conservados de las proteínas asociadas a TolC. 50 6.2.5 Modelamiento estructura terciaria proteínas homólogas de TolC. ................ 51 6.2.6 Ubicación del gen mdtK en el Cromosoma de E. coli K12. .......................... 52 6.2.7 Vecindad topológica conservada del gen mdtK. ........................................... 53 6.2.9 Red interacción proteína – proteína MdtK .................................................... 54 6.2.10 Alineamiento de dominios conservados de las proteínas asociadas a MdtK. ............................................................................................................................. 55 6.2.11 Modelamiento estructura terciaria proteínas homólogas de MdtK. ............. 56 7. DISCUSIÓN .................................................................................................. 58 8. CONCLUSIONES .......................................................................................... 61 9. RECOMENDACIONES .................................................................................. 62 BIBLIOGRAFÍA ..................................................................................................... 63spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.publisherBucaramanga : Universidad de Santander, 2019spa
dc.rightsDerechos Reservados - Universidad de Santander, 2019spa
dc.titleIdentificación de los genes de resistencia MDTK y TOLC de la bomba de eflujo en aislados clínicos de Escherichia coli resistentes a quinolonas y fluoroquinolonasspa
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dc.description.versionEj. 1spa
dc.contributor.educationalValidatorTrejos Suárez, Juanita-
dc.identifier.localT 17.19 J171i-
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercialspa
dc.subject.proposalEscherichia colispa
dc.subject.proposalmdtKspa
dc.subject.proposalReacción en Cadena de la Polimerasaspa
dc.subject.proposalPolymerase Chain Reactionspa
dc.subject.proposaltolC.spa
dc.type.dcmi-type-vocabularyTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionspa
dc.description.abstractenglishIn recent years, resistance to antibiotics has increased exponentially, causing a great public health problem worldwide. Bacteria have developed different resistance mechanisms to inhibit the action of antibiotics. One of these mechanisms is efflux pumps, which have the function of expelling the drug from the inside of the cell to the outside to reduce toxicity and prevent the death of the bacteria. Objective: To determine the presence of the mdtK and tolC resistance genes of the efflux pump in pediatric clinical isolates of Escherichia coli with phenotypic patterns of multidrug resistance. Methodology: In this descriptive study, we included 66 E. coli isolates with phenotypic patterns of Sensitivity, Intermediate Sensitivity and Resistance to Ciprofloxacin and Nalidixic Acid, in a pediatric population of Bucaramanga and its metropolitan area. A conventional PCR was standardized for the identification of the tolC and mdtK genes. Subsequently, 9 amplifications were selected for convenience for sequencing studies and mutation analysis. Subsequently, bioinformatic tools were used to perform the analysis of the sequences obtained. Results: The mdtK and tolC genes were identified in 100% of the analyzed isolates. Regarding the bioinformatics results, homology was found in the expression of the ASJ42092.1 protein with the tolC gene and the ASI16402.1 protein with the mdtK gene involved in the active efflux of quinolones and fluoroquinolones. Conclusions: The presence of the tolC and mdtK genes was determined in pediatric clinical isolates, genes involved in the active efflux of quinolones and fluoroquinolones.spa
dc.thesis.nameBacteriólogo y Laboratorista Clínicospa
dc.thesis.disciplineFacultad de Ciencias de la Salud - Bacteriología y Laboratorio Clínicospa
dc.thesis.levelPregradospa
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