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Title: Genes de resistencia a quinolonas de Escherichia Coli aislada de población pedriátrica del área metropolitana de Bucaramanga
Authors: García González, Claudia Ivonne
Keywords: Escherichia coli
QRDR
PMQR
Mutaciones
Mutations
Issue Date: 2-Dec-2019
Publisher: Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019
Abstract: Different mechanisms of antimicrobial resistance have emerged and expanded in bacteria, threatening the effective treatment of infections. The findings suggest that the commensal enterobacterial microbiota could be an important reservoir of bacterial resistance genes. Therefore, it is necessary to investigate in clinical isolates the prevalence of quinolone resistance genes in isolates of commensal and pathogenic E. coli, since there are no data available in the region that contributes to surveillance to implement strategies that lead to improve the effectiveness of the different antimicrobials used. Descriptive study that includes genomic material of commensal and pathogenic E. coli with phenotypic resistance to quinolones tested with ciprofloxacin of 5 μg and nalidixic acid of 30 μg from 258 clinical isolates of children with EDA and without EDA from Bucaramanga and its metropolitan area. The QRDR regions of the gyrA, gyrB, parC genes and the plasmid resistance genes qnrA, qnrB, oqxAB, qepA and aac6'Ibcr were amplified by conventional PCR for subsequent sequencing, determining the frequency of mutations. Positive products for the aac6´Ibcr gene were processed with BtsCI to confirm their variant. Of 258 strains of E. coli commensals and pathogens, they showed resistance to quinolones 66 (25.6%), of which 51 were pathogenic and 14 non pathogenic. The most frequent plasmid genes were qnrB 18.2%, qnrS 13.6% and aac6'Ibcr 6.1%. Frequent gyrA mutations of H132Y, parC of S80I and various amino acid changes in plasmid genes were found. The presence of the aac6´Ibcr gene was present in E. coli with phenotypes of resistance to nalidixic acid and ciprofloxacin
Diferentes mecanismos de resistencia a los antimicrobianos han surgido y se han expandido en las bacterias, lo que amenaza el tratamiento eficaz de las infecciones. Los hallazgos sugieren que la microbiota enterobacteriana comensal podría ser un reservorio importante de genes de resistencia bacteriana. Por lo tanto, se hace necesario investigar en aislamientos clínicos la prevalencia de genes de resistencia a quinolonas en aislados de E. coli comensales y patógenas, debido a que no existen datos disponibles en la región que aporte a la vigilancia para implementar estrategias, que conduzcan a mejorar la efectividad de los diferentes antimicrobianos utilizados Estudio descriptivo que incluye material genómico de E. coli comensal y patógena con resistencia fenotípica a quinolonas probada con ciprofloxacina de 5 μg y ácido nalidíxico de 30 μg procedente de 258 aislados clínicos de niños con EDA y sin EDA de Bucaramanga y su área metropolitana. Se amplificó por PCR convencional las regiones QRDR de los genes gyrA, gyrB, parC y los genes de resistencia plasmídica qnrA, qnrB, oqxAB, qepA y aac6´Ibcr, para su posterior secuenciación, determinando la frecuencia de mutaciones. Los productos positivos para el gen aac6´Ibcr se procesaron con BtsCI para confirmar su variante. De 258 cepas de E. coli comensales y patógenas, presentaron resistencia a quinolonas 66 (25,6%), de las cuales 51 fueron patógenas y 14 comensales. Los genes plasmídicos con mayor frecuencia fueron qnrB 18,2%, qnrS 13,6% y aac6´Ibcr 6,1%. Se encontraron mutaciones en gyrA frecuentes no descritas de H132Y, parC S80I y diversos cambios aminoacídicos en genes plasmídicos. La presencia del gen aac6´Ibcr estuvo presente en E. coli con fenotipos de resistencia a ácido nalidíxico y ciprofloxacina.
Description: 159 p
URI: https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/4490
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