ACKA. Trabajos de gradohttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/249https://repositorio.udes.edu.co/retrieve/fbe4eba4-26a9-416d-b98b-82ec6db734cd/6.png2024-03-28T13:05:21Z2024-03-28T13:05:21Z311Actividad antibacteriana y citotóxica de bioconjugados de péptidos Ib-M con nanopartículas de óxido de hierro contra Escherichia coli O157:H7 y células veroPrada Prada, Sergio Alfonsohttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/37212022-10-25T16:26:27Z2019-06-14T00:00:00Zdc.title: Actividad antibacteriana y citotóxica de bioconjugados de péptidos Ib-M con nanopartículas de óxido de hierro contra Escherichia coli O157:H7 y células vero
dc.contributor.author: Prada Prada, Sergio Alfonso
dc.description.abstract: Escherichia coli O157:H7 es el patógeno más común aislado en brotes relacionados con alimentos cárnicos, está directamente asociado con el desarrollo del Síndrome Hemolítico Urémico (SHU) y posee gran capacidad para desarrollar resistencia antimicrobiana. Péptidos Ib-M son análogos de Ib-AMP4 (Derivados de Impatiens balsamina) y han mostrado actividad contra E. coli no patógena. Los péptidos suelen ser susceptibles a ser degradados rápidamente en entornos fisiológicos; el uso de nanopartículas de óxido de hierro recubiertas con quitosano (NpOH@Qui) como moléculas transportadoras los protege del efecto de las proteasas y sus propiedades magnéticas los dirige con mayor especificidad a los órganos blanco.
En este estudio se evaluó la actividad contra E. coli O157:H7 y su citotoxicidad en células VERO de péptidos Ib-M y del bioconjugado de péptido Ib-M con nanopartículas de óxido de hierro recubiertas con quitosano (IbM/NpOH@Qui). Para ello, la actividad antibacteriana de los péptidos Ib-M y de IbM/NpOH@Qui se obtuvo al determinar la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI), Concentración Mínima Bactericida (CMB), Cinética de Crecimiento y Letalidad. El efecto citotóxico de los compuestos se evaluó por MTT y posteriormente se calculó la Concentración Citotóxica 50 (CC50) e índices de selectividad (IS).
La CMI de péptidos Ib-M se obtuvo en un rango de 1,6 a 12,5 μM y la CMB de 3,7 a 22,9μM. Células VERO en presencia de péptidos Ib-M mostraron CC50 en un rango de 197,5 a >400 μM. Ib-M1 fue el péptido seleccionado para ser inmovilizado en la NpOH@Qui. El bioconjugado IbM/NpOH@Qui obtuvo una CMI de 12,5 μM contra E. coli O157:H7 y en células VERO una CC50 >25 μM (357 μg/Ml NpOH@Qui). Los péptidos libres y el bioconjugado presentaron actividad in vitro contra E. coli O157:H7. El Bioconjugado se considera un nanotransportador promisorio que una vez sea perfeccionado podría ser llevado a ensayos de experimentación in vivo.; Escherichia coli O157:H7 is the most common pathogen isolated in outbreaks related to meat foods, is directly associated with the development of Hemolytic Uremic Syndrome and has great capacity to develop resistance to antibiotics. Ib-M peptides are analogs of Ib-AMP4 (Derived from Impatiens balsamina) and have shown activity against nonpathogenic E. coli. Peptides are usually susceptible to rapid degradation in physiological environments; the use of iron oxide nanoparticles coated with chitosan (NpOH@Qui) as carrier molecules protects them from the effect of proteases and their magnetic properties direct them with greater specificity to target organs.
In this study the activity against E. coli O157: H7 and its cytotoxicity in VERO cells of Ib-M peptides and peptide bioconjugate Ib-M with iron oxide nanoparticles coated with chitosan (IbM/NpOH@Qui) will be evaluated. The antibacterial activity of Ib-M peptides and IbM/NpOH@Qui was obtained by determining the Minimum Inhibitory Concentration (MIC), Minimum Bactericidal Concentration (MBC), Growth and Lethality Kinetics. The cytotoxic effect of the compounds was evaluated by MTT and then Cytotoxic Concentration 50 (CC50) and selectivity indexes were calculated.
The MIC of peptides Ib-M was obtained in a range of 1.6 to 12.5 μM and the MBC of 3.7 to 22.9 μM. VERO cells in the presence of Ib-M peptides showed CC50 in a range of 197.5 to >400 μM. Ib-M1 was the peptide selected to be immobilized on the NpOH@Qui. The bioconjugate IbM1/NpOH@Qui obtained a CMI of 12.5 μM against E. coli O157: H7 and in VERO cells a CC50 >25 μM (357 μg/mL NpOH@Qui). The free peptides and the bioconjugate showed in vitro activity against E. coli O157:H7. The Bioconjugate is considered a promising nanotransporter that once perfected could be taken to in vivo experimentation trials.
dc.description: 98 p.
2019-06-14T00:00:00ZActividad antimicrobiana de hongos endófitos de plantas medicinales Mammea americana (Calophyllaceae) y Moringa Oleífera (Moringaceae).Mosquera Rivera, Wilmer G.https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/6542022-10-25T15:46:38Z2018-06-26T00:00:00Zdc.title: Actividad antimicrobiana de hongos endófitos de plantas medicinales Mammea americana (Calophyllaceae) y Moringa Oleífera (Moringaceae).
dc.contributor.author: Mosquera Rivera, Wilmer G.
dc.description.abstract: Las enfermedades infecciosas, son la causa principal de muertes en el mundo. En la actualidad, un factor preocupante, es el aumento de la resistencia bacteriana a los antibióticos, siendo esto un problema de salud pública. La Organización Mundial de la Salud (OMS) priorizó la investigación de nuevos antibióticos para el tratamiento de los patógenos multiresistentes. Por tal motivo es necesaria una búsqueda de nuevos nichos y hábitats de agentes antimicrobianos potencialmente eficaces. Siendo asi se evaluó la actividad antimicrobiana de los hongos endófitos de Mammea americana y Moringa Oleífera en Staphylococcus aureus (ATCC® 29213™) y Escherichia coli (ATCC® 25922™).Se llevó a cabo una metodología según un estudio experimental en 60 muestras vegetales. Se aislaron e identificaron hongos endófitos, se les evaluó su actividad antimicrobiana mediante ensayo dual in vitro a través de la presencia de halos de sensibilidad, posteriormente se realizaron recopilaciones continuas de biomasa de los endófitos para obtener extractos de las moléculas bioactivas, a las cuales se les midió la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI ), concentración mínima bactericida (CMB) y citotoxicidad. Las pruebas de antagonismo y sensibilidad in vitro, permitieron preseleccionar 14 hongos con actividad antimicrobiana, de la clase Ascomycete y Deuteromycete, aislados en mayor proporción de semillas y hojas. La mayoría de sus extractos presentaron inhibición tanto de las cepas sensibles como de las resistentes para las dos bacterias. Considerando los resultados de las CMI, CMB y citotoxicidad, se demostró que los hongos endófitos poseen características bactericidas sin ocasionar daño alguno. Las pruebas de sensibilidad in vitro permitieron seleccionar y conocer los endófitos con posibles metabolitos secundarios con propiedades antimicrobianas y no tóxicas, por esta razón los hallazgos encontrados son importantes para continuar con investigaciones sobre los mecanismos de acción, resaltando que el aislamiento de endófitos en estas plantas es escaso o desconocido; Infectious diseases are the leading cause of deaths worldwide. Currently, a worrying factor is the increase in bacterial resistance to antibiotics, being this a public health problem. World Health Organization (OMS). prioritized research into new antibiotics for the treatment of multiresistant pathogens. Therefore a search for new niches and habitats potentially effective antimicrobial agents is needed. It was evaluated the antimicrobial activity of endophytic fungi Mammea Americana (Calophyllaceae). and Moringa oleífera in Staphylococcus aureus (Staphylococcus ATCC® 29213 ™). and Escherichia coli (ATCC® 25922 ™). a methodology was carried out according to an experimental study in 60 plant samples. They were isolated and identified endophytes were evaluated for their antimicrobial activity using assay dual in vitro through the presence of halos of sensitivity, then continuous collections biomass endophytes were performed to obtain extracts of bioactive molecules, to which were measured for minimum inhibitory concentration (MIC), minimum bactericidal concentration (MBC) and cytotoxicity. The tests of antagonism and sensitivity in vitro, allowed preselecting 14 fungi with antimicrobial activity, of the class Ascomycete and Deuteromycete, isolated in greater proportion of seeds and leaves. Most extracts showed inhibition of both sensitive strains as resistant to both bacteria. Considering the results of the CMI, CMB and cytotoxicity demonstrate that endophytes have bactericidal properties without causing any damage. Sensitivity tests in vitro They allowed to meet endophytes with possible secondary metabolites with antimicrobial and non-toxic properties, for this reason the findings are important to continue research on the mechanisms of action, noting that the isolation of endophytes in these plants is scarce or unknown.
dc.description: 144 p. cd
2018-06-26T00:00:00ZAsociación de la percepción del riesgo y la experiencia con los conocimientos actitudes y prácticas sobre el dengue en la población de Riohacha, La Guajira, ColombiaBenítez Díaz, Lilianahttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/6352022-10-25T15:10:24Z2017-05-22T00:00:00Zdc.title: Asociación de la percepción del riesgo y la experiencia con los conocimientos actitudes y prácticas sobre el dengue en la población de Riohacha, La Guajira, Colombia
dc.contributor.author: Benítez Díaz, Liliana
dc.description.abstract: El dengue es una enfermedad endémica en La Guajira y su capital Riohacha, aporta la
mayoría de los casos reportados por la región. Siguiendo las recomendaciones de la OMS
para el control del dengue, las cuales enfatizan en la importancia de la movilización social
y la comunicación en salud, para lograr cambios de comportamiento en la comunidad,
orientados hacía la eliminación de criaderos de mosquitos, se ha propuesto realizar una
investigación para estimar la asociación entre la percepción del riesgo y la experiencia de
casos de dengue con los conocimientos, actitudes y prácticas (CAP) sobre dengue, en la
población de Riohacha, La Guajira, con el fin de planear programas de intervención
adaptados a las necesidades y realidades de la localidad. Para ésto se diseñó un estudio
analítico de corte transversal, mediante muestreo probabilístico, polietápico por
conglomerados, los datos recolectados se analizaron para su descripción y se ajustaron
modelos de regresión log binomial o de Poisson opción robusta, con los que se
establecieron las asociaciones. Se entrevistaron 206 familias y menos del 10% saben la
naturaleza viral del dengue y menos del 40% identificaron otros síntomas diferentes a la
fiebre. En cuanto a las prácticas, menos del 40% de la población realiza eliminación de
criaderos y el 58% fumiga. La participación en actividades comunitarias fue menor del
30% en la mayoría de ellas, sin embargo, más del 80% de la población percibe el riesgo
de dengue. El análisis multivariado mostró una asociación significativa entre la
percepción del riesgo con el conocimiento sobre el vector (RP=3,32 IC95% 1,06–10,36)
y la experiencia de dengue con la actitud frente al control del dengue (RP=1,61 IC95%
1,09–2,37). En conclusión, la percepción del riesgo y la experiencia con dengue podrían
jugar un papel determinante en los CAP frente al control del dengue.; Dengue is an endemic disease in the region of La Guajira and the municipality of
Riohacha, its capital, contributes the majority of the cases reported by the region.
Following the recommendations of WHO for the control of dengue, which emphasizes
the importance of social mobilization and communication in health, to achieve changes
in behavior in the community, aimed at the elimination of mosquito breeding sites, it has
been proposed to carry out an investigation to estimate the association between the risk
perception and the experience of dengue cases with knowledge, attitudes and practices
(KAP) on dengue, in Riohacha, La Guajira, in order to plan intervention programs
adapted to the needs and realities of the locality. For this we designed an analytical crosssectional
study, through probabilistic, multi-stage sampling by clusters, the data collected
was analyzed for their description and we fitted models of binomial log regression or
Poisson robust option, with which associations were established. 206 families were
interviewed and less than 10% knew the viral nature of dengue fever and less than 40%
identified other symptoms than fever. In terms of practices, less than 40% of the
population makes removal of breeding and 58% fumigates and participation in
community activities was less than 30% in most of them, however, more than 80% of the
population perceives the risk of dengue. The multivariate analysis showed a significant
association between the risk perception and the knowledge about the mosquito (RP=3,32
IC95% 1,06–10,36) and the experience with dengue with the attitude against dengue
control (RP=1,61 IC95% 1,09–2,37). In conclusion, the risk perception and experience
with dengue could play a determinant role in KAP against dengue control.
dc.description: 85 p. Cd
2017-05-22T00:00:00ZBioactividad de Complejos Metálicos con Ligandos Azólicos Sobre el Crecimiento Planctónico y Adherente de Especies de Candida Sensibles y Resistentes al FluconazolDurán-Barajas, Sandra Milenahttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/59262022-10-25T15:18:03Z2021-11-29T00:00:00Zdc.title: Bioactividad de Complejos Metálicos con Ligandos Azólicos Sobre el Crecimiento Planctónico y Adherente de Especies de Candida Sensibles y Resistentes al Fluconazol
dc.contributor.author: Durán-Barajas, Sandra Milena
dc.description.abstract: La candidiasis invasiva es un problema de salud mundial que afecta principalmente a pacientes hospitalizados con inmunosupresión, trasplantes y pacientes en cuidados intensivos. Candida albicans es el principal agente etiológico, sin embargo, en los últimos años se ha documentado el aumento de la distribución de especies no-albicans resistentes a los fármacos especialmente al grupo de los azoles. El objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto antifúngico de complejos metálicos de cromo, cobre y cobalto con ligandos azólicos sobre cultivos planctónicos y adherentes de cepas de Candida spp. sensibles y resistentes al fluconazol. Se evaluó el efecto de complejos metálicos de cromo, cobre y cobalto con ligandos azólicos y los precursores sobre el crecimiento planctónico y adherente de C. albicans, C. tropicalis y C. parapsilosis mediante la técnica de microdilución en caldo (CLSI M27-A4) y la medición de la actividad metabólica se evaluó por el método del XTT. Además, se determinó el efecto citotóxico in vitro de los compuestos por el método del MTT. Los resultados demostraron que los complejos de cromo (III) y cobalto (II) con ligandos triazólicos inhibieron mayormente el crecimiento planctónico de las cepas de Candida no-albicans con CMI entre 7,8– 62,5 μg/mL, siendo C. parapsilosis la especie mayormente inhibida. Con relación al crecimiento adherente, los complejos metálicos de cobalto con ligandos triazólicos mostraron efecto anti-biopelícula sobre las cepas de Candida albicans (SCMI50 65,2 - 500 μg/mL), siendo el complejo metálico CoL2 el que exhibió mayor efecto inhibitorio sobre C. albicans CAP F-13 (SCMI50 de 62,5 μg/mL). En cuanto a la citotoxicidad, los complejos metálicos con ligandos azólicos no presentaron actividad citotóxica sobre las células J774.A1 (CC50 y CC90 >100 μg/mL).; Invasive candidiasis is a global health problem that mainly affects hospitalized patients with immunosuppression, transplants and patients in intensive care. Candida albicans is the main etiological agent, however, in recent years an increase in the distribution of drug-resistant non-albicans species, especially the group of azoles, has been documented. The aim of this work was to evaluate the antifungal effect of metal complexes of chromium, copper and cobalt with azole ligands on planktonic and adherent cultures of strains of Candida spp. sensitive and resistant to fluconazole. The effect of chromium, copper and cobalt metal complexes with azole ligands and precursors on the planktonic and adherent growth of C. albicans, C. tropicalis and C. parapsilosis was evaluated using the broth microdilution technique (CLSI M27-A4) and the measurement of metabolic activity was evaluated by the XTT method. Furthermore, the in vitro cytotoxic effect of the compounds was determined by the MTT method. The results showed that the complexes of chromium (III) and cobalt (II) with triazole ligands inhibited the planktonic growth of non-albicans strains of Candida with MIC between 7.8–62.5 μg / mL, being C. parapsilosis the mostly inhibited species. Regarding adherent growth, cobalt metal complexes with triazole ligands showed an anti-biofilm effect on Candida albicans strains (SCMI50 65.2 - 500 μg / mL), being the CoL2 metal complex the one that exhibited the greatest inhibitory effect on C. albicans CAP F-13 (SCMI50 of 62.5 μg / mL). Regarding cytotoxicity, the metal complexes with azole ligands did not show cytotoxic activity on J774.A1 cells (CC50 and CC90> 100 μg / mL).
dc.description: Digital
2021-11-29T00:00:00ZCaracterización de la actividad tripanocida y citotóxica de aceites esenciales de lippia alba y sus terpenos bioactivos sobre trypanosoma cruziMoreno Moreno, Erika Marcelahttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/6372022-10-25T15:40:34Z2017-06-09T00:00:00Zdc.title: Caracterización de la actividad tripanocida y citotóxica de aceites esenciales de lippia alba y sus terpenos bioactivos sobre trypanosoma cruzi
dc.contributor.author: Moreno Moreno, Erika Marcela
dc.description.abstract: La Enfermedad de Chagas es una infección causada por el protozoario Trypanosoma cruzi, la cual es caracterizada por un prolongado curso silencioso y complejas manifestaciones clínicas. Actualmente, no existe evidencia contundente de quimioterapéuticas eficaces, lo que hace obligatoria la búsqueda de nuevos agentes tripanocidas más efectivos. Bajo este escenario, fármacos extraídos de plantas resultan prometedores, teniendo en cuenta su baja toxicidad y amplio espectro farmacológico. De acuerdo con esto, en este trabajo se evaluó la actividad tripanocida in vitro de aceites esenciales (AEs) de Lippia alba y de sus terpenos bioactivos (óxido de cariofileno, citral, limoneno y carvona), caracterizándose el mecanismo de muerte celular inducido contra T.cruzi. Los resultados fueron expresados como la concentración inhibitoria o citotóxica 50 (CI50 y CC50, respectivamente), realizando regresión sigmoidal mediante el Software estadístico MsxlfitTM. El fenotipo de muerte fue rastreado por microscopía óptica y de fluorescencia, citometría de flujo y electroforesis de ADN. El análisis estadístico se realizó por ANOVA de Welch (software SPSS 15.0). En las condiciones testadas, los AEs y terpenos de L. alba ejercieron efectos inhibitorios distintos en los tres estadios parasitarios evaluados (p=0.000). Los AEs del quimiotipo Citral exhibieron concentraciones inhibitorias medias menores (Epimastigotes: CI50 13,6±1,5μg/mL; Tripomastigotes: CI50 21,9±1,4 μg/mL; Amastigotes: CI50 74,1±4,4μg/mL) que las alcanzadas con los aceites del quimiotipo Carvona (Epimastigotes: CI50 88,2±3,7μg/mL; Tripomastigotes: CI50 44,9±2,5μg/mL; Amastigotes: CI50 >150μg/mL). El limoneno representó el terpeno de mayor selectividad (Epimastigotes: IS 7,1; Tripomastigotes: IS 32,8; Amastigotes: IS 10,3) y menor toxicidad sobre células Vero (Limoneno: CC50 297,1±2,4μg/mL). Además, el limoneno evidenció una interacción sinérgica in vitro con el Benznidazol (Epimastigotes CIF=0,44±0,13; tripomastigotes CIF=0,42±0,10; amastigotes CIF=0,58±0,13μg/mL) y con el óxido de cariofileno (Epimastigotes: CIF 0,49; Tripomastigotes: CIF 0,45; Amastigotes: CIF 0,71μg/mL). Los análisis celulares sugieren que la muerte celular observada en el T. cruzi podría ser mediada por un mecanismo tipo-apoptótico.; Chagas Disease is caused by infection of Trypanosoma cruzi parasite. In general, the course of the disease is characterized by a prolonged silent phase and a complex clinical presentation. Currently, there is no compelling evidence of effective chemotherapeutics, making compulsory the research on more effective and selective therapies.In this way, plants offer a promissory reserve of bioactive molecules, take into account their low toxicity and width pharmacologic spectrum. In this work, the in vitro trypanocidal activity of Lippia alba essential oils (EOs) and their bioactive terpenes (caryophyllene oxide, citral, limonene and carvone) was evaluated, following the death mechanism induced on T. cruzi cells. The results were expressed as Inhibitory Concetration 50 (IC50) or Cytotoxic Concentration (CC50) by sigmoidal regression using the statistical software MsxlfitTM. Optical and fluorescent microscopy, flow cytometry, and DNA electrophoresis were used for characterization of the cell death phenotype. The statistical analysis was made by Welch’s ANOVA (software SPSS 15.0). In the conditions tested, the L. alba EOs and their terpenes exhibed a different tripanocidal performance on the diverse parasites stages (p=0.000). Citral chemotype oils evidenced lower IC50 (Epimastigotes: IC50 13,6±1,5μg/mL; Trypomastigotes: IC50 21,9±1,4 μg/mL, and Amastigotes: IC50 74,1±4,4μg/mL) than Carvone chemotype EOs (Epimastigotes: IC50 88,2±3,7μg/mL; Trypomastigotes: IC50 44,9±2,5μg/mL, and Amastigotes: IC50 >150μg/mL). The better selectivity index (SI) was achieved by the monoterpene limonene (Epimastigotes: SI=7,1; Trypomastigotes: SI=32,8, and Amastigotes: SI=10,3), with a CC50 value on Vero cells of 297,1±2,4μg/mL. Limonene presented in vitro synergistic interaction with Benznidazole (with a Fractional Inhibitory Concentration (FIC) of 0,44±0,13, 0,42±0,10 and 0,58±0,13μg/mL for epimastigotes, trypomastigotes, and intracellular amastigotes, respectively), and with caryophyllene oxide (Epimastigotes: FIC=0,49; Tripomastigotes: FIC=0,45; Amastigotes: FIC=0,71). The cellular analysis suggested that these oils or their bioactive terpenes (caryophyllen oxide/limonene) could be inducing cell death by an apoptotic like mechanisms on T. cruzi.
dc.description: 100 p. Cd-
2017-06-09T00:00:00ZCaracterización genotípica y fenotípica de cepas emergentes de Escherichia coli aisladas de niños con diarrea en Bucaramanga y su área metropolitana, Colombia.Arias Guerrero, Monica Y.https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/6312022-10-25T14:57:43Z2016-10-21T00:00:00Zdc.title: Caracterización genotípica y fenotípica de cepas emergentes de Escherichia coli aisladas de niños con diarrea en Bucaramanga y su área metropolitana, Colombia.
dc.contributor.author: Arias Guerrero, Monica Y.
dc.description.abstract: Acute diarrheal disease (ADD) remains a major public health problems in developing countries. Among the infectious agents that cause this disease are bacteria, viruses and parasites. Bacterial agents take second place enteropathogenic Escherichia coli standing out among the most important. Currently, six strains with different pathogenic mechanisms are associated with diarrhea enteropathogenic E. coli (EPEC), shiga-toxin producing (STEC), enterotoxigenic (ETEC), enteroinvasive (EIEC), Enteroaggregative (EAEC) and diffusely adherent (DAEC), each with a specific set of virulence genes. However, there have been outbreaks of ADD caused by E. coli strains different from the known pathotypes, called emerging strains. These outbreaks have been reported in Germany, Europe, Argentina and recently in Cartagena, Colombia, suggesting that these strains circulating our environment, so it is necessary to characterize these emerging strains. Objective: To characterize genotypically and phenotypically two emerging strains of E. coli isolated from diarrheal samples in children under five in Bucaramanga and its metropolitan area, Colombia. Methods: A descriptive study was conducted at the genetic and phenotypic two emerging strains previously isolated from a case-control study conducted between July 2013 and December 2014 in Bucaramanga and its metropolitan area. In this study, two emerging strains were characterized by phenotypic and genotypic different methods like MLST analysis, virulence gene sequencing, serotyping, biofilm formation, actin polymerization, adhesion tests and antimicrobial susceptibility. Results: genotypically and phenotypically characterized two emerging strains of E. coli mixed genotype. The first one enteropathogenic E coli enteroaggregative-mixed based on its genotype and phenotype of adhesion assays in HeLa cells and the second a strain of enterotoxigenic E. coli enteroaggregative-mixed based on its genotype and expression of LT.
Keywords: Diarrhea, Escherichia coli, pathotypes, emerging, Colombia.; La enfermedad diarreica aguda (EDA) sigue siendo uno de los principales problemás en salud pública en países en desarrollo. Dentro de los agentes infecciosos que causan esta enfermedad se encuentran bacterias, virus y parásitos. Los agentes bacterianos ocupan un segundo lugar destacándose Escherichia coli enteropatógena entre las más importantes. Actualmente, seis cepas con diferentes mecanismos de patogenicidad están asociados a diarrea E. coli enteropatógena (EPEC), productora de toxina-shiga (STEC), enterotoxigénica (ETEC), enteroinvasiva (EIEC), enteroagregativa (EAEC) y adherente difusa (DAEC), cada una con un set específico de genes de virulencia. No obstante, se han reportado brotes de EDA ocasionados por cepas de E. coli diferentes a los patotipos conocidos, denominadas cepas emergentes. Estos brotes han sido reportados en Alemania, Europa, Argentina y recientemente en Cartagena, Colombia, lo que sugiere que en nuestro medio circulan estas cepas, por lo que se hace necesario caracterizar estas cepas emergentes. Objetivo: Caracterizar genotípicamente y fenotípicamente dos cepas emergentes de E. coli aisladas de muestras diarreicas en niños menores de cinco años en Bucaramanga y su área metropolitana, Colombia. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo a nivel genético y fenotípico de dos cepas emergentes previamente aisladas de un estudio de casos y controles realizado entre julio del 2013 y diciembre del 2014 en Bucaramanga y su área metropolitana. En este estudio, dos cepas emergentes fueron caracterizadas fenotípica y genotípicamente mediante diferentes métodos como análisis de MLST, secuenciación de genes de virulencia, serotipificación, formación de biofilm, polimerización de actina, ensayos de adhesión y susceptibilidad antimicrobiana. Resultados: Se caracterizaron genotípicamente y fenotípicamente dos cepas emergentes con genotipo mixto de E. coli. La primera una E coli enteroagregativa-enteropatogena con base en su genotipo mixto y el fenotipo de ensayos de adherencia en células HeLa y la segunda una cepa de E. coli enteroagregativa-enterotoxigenica con base en su genotipo mixto y la expresión de LT.
Palabras claves: Diarrea, Escherichia coli, patotipos, emergentes, Colombia.
dc.description: 128 p. Cd
2016-10-21T00:00:00ZCaracterización genómica y proteómica de aislados ambientales y clínicos de cryptococcus gattii y C. Neoformans en Cúcuta, Norte de Santander, ColombiaAngarita Sánchez, Asbleide Karinahttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/44282022-10-25T16:04:57Z2019-09-27T00:00:00Zdc.title: Caracterización genómica y proteómica de aislados ambientales y clínicos de cryptococcus gattii y C. Neoformans en Cúcuta, Norte de Santander, Colombia
dc.contributor.author: Angarita Sánchez, Asbleide Karina
dc.description.abstract: La Criptococosis es una micosis oportunista, adquirida por la inhalación de propágulos fúngicos presentes en el ambiente, siendo una infección potencialmente fatal que afecta los pulmones y el sistema nervioso central, tanto en personas inmunosuprimidas como inmunocompetentes, causada por dos especies patógenas para humanos. El Grupo Colombiano para el estudio de la Criptococosis ha reportado aislamientos de Cryptococcus neoformans y C. gattii tanto a partir de muestras clínicas como ambientales en la ciudad de Cúcuta, considerado un municipio relevante respecto al reporte de casos de ambas especies, en encuestas nacionales. El objetivo de este estudio fue establecer la concordancia entre relación genética y proteómica de aislados clínicos y ambientales de C. neoformans y C. gattii en la ciudad de Cúcuta, se colectaron un total 1300 muestras de 446 árboles de 10 especies diferentes a partir de 10 zonas públicas; adicionalmente, se obtuvieron 6 aislamientos clínicos de C. neoformans durante junio de 2016 a junio de 2017, provenientes de la Empresa Social del Estado Hospital Universitario Erasmo Meoz, los cuales fueron cultivados en agar semillas de Guizottia abysinica para identificación fenotípica por pruebas bioquímicas y se realizó tipificación genética por PCR-huella digital, RFLP-URA5 y caracterización proteómica empleando MALDI TOF MS. Se obtuvieron 19/446 (4,3%) árboles positivos para aislamiento de C. neoformans y 1/446 (0,2%) para C. gatti en la población arbórea evaluada para un total de 21 aislamientos (dos de un mismo individuo), de los cuales 10/21 (47,6%), correspondientes a C. neoformans, provenían del Parque Santander y el único aislado de C. gattii provenía del parque Mercedes Ábrego. Con relación a los aislamientos clínicos 6/6(100%) fueron identificados como C. neoformans var. grubii VNI.; Cryptococosis is an opportunistic mycosis, acquired by the inhalation of fungal propagules present in the environment, being a potentially fatal infection that affects the lungs and the central nervous system, is that affects immunocompetent and immunodeficient individuals, caused by two pathogenic species for humans. The Colombian Group for the study of Criptococosis has reported isolates of Cryptococcus neoformans and C.gattii in both clinical and environmental samples in the city of Cúcuta. considered a relevant city regarding the reporting of cases of both species, in national surveys. The objective of this study las to establish the concordance between the genetic and proteomic relationship of clinical and environmental isolates of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii in the city of Cúcuta. A total of 1300 samples were collected from 446 trees of 10 different species from 10 public areas; additionally, they were obtained 6 clinical isolates of Cryptococcus neoformans. were obtained during June 2016 to June 2017, from Hospital Universitario Erasmo Meoz were cultivated in Guizottia abysinica medium and were then biochemically identified and genetic typing by Fingerprinting PCR, RFLP of the URA5 gene and proteomics by MALDI TOF MS. This yielded 19/446 (4.3%) positive trees for isolation of C. neoformans and 1/446 (0.2%) for C. gatti, the tree population evaluated for a total of 21 isolates (two from the same individual), of which 10/21 (47.6%), corresponding to C. neoformans, came from the Santander Park and the only one isolated from C. gattii came from the Mercedes Ábrego Park. In relation to clinical isolates 6/6 (100%) were identified as C. neoformans var. grubii VNI.
dc.description: 84 p
2019-09-27T00:00:00ZCardioprotección por antioxidantes mitocondriales en cardiomiocitos humanos infectados con Trypanosoma cruziRodríguez Avila, Yudy A.https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/6402022-10-25T15:14:12Z2017-10-15T00:00:00Zdc.title: Cardioprotección por antioxidantes mitocondriales en cardiomiocitos humanos infectados con Trypanosoma cruzi
dc.contributor.author: Rodríguez Avila, Yudy A.
dc.description.abstract: La cardiomiopatía chagásica es el evento más serio y más frecuente de la enfermedad de chagas. La invasión por T. cruzi genera alteraciones en la función mitocondrial del cardiomiocito que se traducen a pérdida del potencial de membrana mitocondrial, generación de especies reactivas de oxígeno ROS y alteración en el balance antioxidante, contribuyendo a un desequilibrio metabólico y oxidativo en el miocardio chagásico. Nosotros evaluamos los efectos de nitróxidos miméticos de SOD (SG1 y Mito-SG1) y del tratamiento de referencia BZN sobre la capacidad pro-oxidante, la bioenergética celular e infectividad de cardiomiocitos humanos AC16 infectados con T. cruzi. Materiales y Métodos: La citotoxicidad celular fue realizada por el ensayo MTT. La infectividad parasitaria fue determinada por citometría de flujo, utilizando el reactivo CFSE. La bioenergética celular se determinó con el sistema Seahorse XFe-24 Analyzer y la producción de ROS Mitocondrial por MitoSOX™ Red. Resultados: El CC50 para SG1 fue de 4790 μM, para Mito-SG1 de 5,0 μM. BZN y Mito-SG1 tuvieron efectos en la disminución de la tasa de infectividad de los cardiomiocitos humanos. Se obtuvo diferencias significativas en los efectos pro-oxidantes de los cardiomiocitos tratados con BZN. Se observaron cambios importantes estadísticamente en los parámetros de respiración basal, producción de ATP, protón leak y respiración máxima en los cardiomiocitos infectados con T. cruzi. La capacidad de reserva respiratoria disminuyo en los cardiomiocitos infectados y sometidos a los tratamientos con BZN, SG1 y Mito-SG1. Conclusiones: El cardiomiocito humano sufre perturbaciones metabólicas tempranas que involucran cambios en el consumo de oxígeno y perfil bioenergético hacia la utilización de la vía glucolítica. La disminución de la infectividad en los cardiomiocitos tratados con Mito-SG1, es un hallazgo que permite realizar estudios futuros con el fin de determinar posibles efectos antiparásitarios del mitocompuesto.; Chagasic cardiomyopathy is the most serious and frequent event of this disease. Previous studies have shown that infection by T. cruzi induces alterations in mitochondrial function of cardiomyocytes that result in loss of mitochondrial membrane potential, generation of reactive species ROS and alteration in the antioxidant balance, contributing to a metabolic and oxidative imbalance in the chagasic myocardium. We evaluated the effects of SOD mimetic mitochondria targeted and non-targeted nitroxides compounds SG1 and Mito-SG1 and the reference treatment on pro-oxidant capacity, cellular bioenergetics and infectivity of human cardiomyocytes infected with T. cruzi. Materials and methods: Cellular cytotoxicity was determined by the MTT assay. Flow cytometry determined infectivity, using the CFSE reagent for labeling of infective tripomastigotes. The bioenergetics and mitochondrial function was determined with Seahorse XFe-24 Analyzer, and production of superoxide by MitoSOX™ Red. Results: The CC50 was determined ≥ 4790μM for SG1, for Mito-SG1 of 5,0μM. Significant differences were found in the pro-oxidant effects of the cardiomyocytes treated with BZN and BZN more infection. Statistically significant changes were observed in the parameters of Basal respiration, ATP production, Proton leak and Maximal respiration in cardiomyocytes infected with T. cruzi. Spare Respiratory Capacity decreased in cardiomyocytes under treatment with BZN, SG1 and Mito-SG1 and T. cruzi infection. BZN and Mito-SG1 had effects in decreasing the infectivity rate of human cardiomyocytes. Conclusions: The AC16 human cardiomyocyte presents early metabolic disturbances that involve changes in oxygen consumption and bioenergetic profile towards the use of the glycolytic pathway. The decrease in infectivity in cardiomyocytes treated with Mito-SG1 is a finding that allows for future studies to determine the possible antiparasitic effects of this compound.
dc.description: 109 p. Cd
2017-10-15T00:00:00ZConcordancia Entre TST e IGRA en Colombianos con Diagnóstico Reciente de Infección por VIH sin Tratamiento Antirretroviral PrevioPedraza Hernández, Leidy Johannahttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/54622022-10-25T16:20:20Z2021-05-28T00:00:00Zdc.title: Concordancia Entre TST e IGRA en Colombianos con Diagnóstico Reciente de Infección por VIH sin Tratamiento Antirretroviral Previo
dc.contributor.author: Pedraza Hernández, Leidy Johanna
dc.description.abstract: En Colombia la incidencia de VIH/SIDA ha aumentado. La coinfección con Mycobacterium tuberculosis se asocia a mayor morbi-mortalidad. La prueba cutánea de tuberculina (TST) solo se realiza al 48,7% de los pacientes con VIH; una alternativa es el ensayo de liberación de interferón (IGRA). Se ha reportado variabilidad en la concordancia entre estas dos pruebas en población con VIH, pero no se ha evaluado la IGRA de cuarta generación. El objetivo del estudio fue evaluar la concordancia entre TST y QuantiFERON-TB Gold Plus (QTF-plus, cuarta generación), y los factores asociados a la positividad de estas pruebas en colombianos con VIH sin tratamiento antirretroviral. Se realizó un estudio de evaluación de tecnología diagnóstica con muestreo no probabilístico en Antioquia y Valle del Cauca. Se realizó entrevista, QTF-plus, TST y radiografía de tórax. Se determinó la concordancia entre las pruebas y se realizó análisis univariado y múltiple con regresión logística para establecer los factores asociados a la positividad. Entre 20/agosto/2019 y 26/febrero/2021 se reclutaron 151 pacientes y se excluyeron dos. De los 149 pacientes, 79,9% eran hombres, 50% tenía entre 23,5 y 38 años, y 47,6% estaban en estadio 2 de VIH. 3,4% no regresaron para la lectura de TST. 17,5% presentaron al menos una prueba positiva, de estos posibles casos de Tuberculosis latente, 42,3% fueron detectados solo por QTF-plus. El acuerdo fue de 87,9% (Kappa de Cohen de 0,4183; IC95% 0,192–0,645). La cantidad de linfocitos T CD4+ (ORa 1,39; IC95%:1,10–1,74), el porcentaje de linfocitos T CD4+ (ORa 1,11; IC95%:1,04–1,18) y el género se asociaron con la positividad de QTF-plus. En colombianos VIH positivos sin tratamiento antirretroviral la concordancia entre TST y QTF-plus fue baja. La implementación de QTF-plus en el algoritmo colombiano de manejo de pacientes con VIH permitiría detectar una mayor cantidad de posibles coinfecciones VIH/Tuberculosis latente.; In Colombia the incidence of HIV / AIDS has increased. Coinfection with Mycobacterium tuberculosis is associated with higher morbidity and mortality. The tuberculin skin test (TST) is only performed in 48.7% of patients with HIV; an alternative is the interferon release assay (IGRA). Variability in concordance between these two tests has been reported in the HIV population, but fourth-generation IGRA has not been evaluated. The objective of the study was to evaluate the concordance between TST and QuantiFERON-TB Gold Plus (QTF-plus, fourth generation), and the factors associated with the positivity of these tests in Colombians with HIV without antiretroviral treatment. A diagnostic technology evaluation study with non-probability sampling was carried out in Antioquia and Valle del Cauca. An interview, QTF-plus, TST and chest X-ray were performed. Concordance between the tests was determined and univariate and multiple analyzes with logistic regression were performed to establish the factors associated with positivity. Between August 20, 2019 and February 26, 2021, 151 patients were recruited and two were excluded. Of the 149 patients,
79.9% were male, 50% were between 23.5 and 38 years old, and 47.6% were stage 2 HIV. 3.4% did not return for the TST reading. 17.5% presented at least one positive test, of these possible cases of latent tuberculosis, 42.3% were detected only by QTF-plus. The agreement was 87.9% (Cohen's Kappa 0.4183; 95% CI 0.192–0.645). The number of CD4 + T lymphocytes (ORa 1.39; 95% CI: 1.10-1.74), the percentage of CD4 + T lymphocytes (ORa 1.11; 95% CI: 1.04-1.18) and gender were associated with QTF-plus positivity. In HIV-positive Colombians without antiretroviral treatment, the concordance between TST and QTF-plus was low. The implementation of QTF-plus in the Colombian algorithm for the management of patients with HIV would allow the detection of a greater number of possible HIV / latent tuberculosis co-infections.
dc.description: Digital
2021-05-28T00:00:00ZDesarrollo de un Modelo Pronóstico de Falla Virológica en Personas que Viven con VIH en el Departamento de AntioquiaPerez-Casanova, Ana Marcelyhttps://repositorio.udes.edu.co/handle/001/72392022-10-25T16:05:38Z2022-06-06T00:00:00Zdc.title: Desarrollo de un Modelo Pronóstico de Falla Virológica en Personas que Viven con VIH en el Departamento de Antioquia
dc.contributor.author: Perez-Casanova, Ana Marcely
dc.description.abstract: El Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH) es una de las enfermedades con mayor morbilidad y mortalidad en el mundo. La falla virológica es la incapacidad para mantener la supresión de la replicación viral (ARN de VIH <200 copias/mL) después de 6 meses de tratamiento antirretroviral de gran actividad (TARGA).El objetivo de nuestro estudio fue desarrollar un modelo pronóstico de falla virológica en personas que viven con VIH en Antioquia, Colombia. Realizamos un estudio de cohorte histórica. Se incluyeron pacientes VIH de cualquier sexo mayores de 13 años atendidos en la IPS CIB salud que iniciaron su primer esquema de TARGA entre 1de julio del 2016 y 31de diciembre del 2019. Para el desarrollo del modelo, se empleó regresión logística univariada y multivariada, y se determinó el rendimiento por medio de la calibración (prueba Hosmer-Lemeshow), y la discriminación (área bajo la curva operador del receptor -AUC). Se incluyeron al estudio 211 pacientes VIH, la mayoría pertenecían al sexo masculino y tenían una mediana de edad de 27 años. Se desarrollaron cinco modelos pronósticos con rendimiento similar, AUC con discriminación entre 0,9355 y 0,9471, y calibración con valores cercanos a 1.Recomendamos el modelo cuatro y cinco que incluyeron variables como ser trabajador independiente, la adherencia a la TARGA < 95%, la pérdida de más de una cita durante el seguimiento, la carga viral ≥ 50.000 copias/ml y la relación inicial de linfocitos TCD4+CD8 <0,5asociados estadísticamente a la falla virológica. Investigar el fracaso virológico en pacientes VIH que reciben TARGA es fundamental para determinar el estado actual del tratamiento y los factores asociados a desarrollar falla virológica. Si bien los modelos desarrollados tienen buena calibración y discriminación, es importante realizar un estudio devalidación externa para que sepuedanutilizar en los diferentes programasde VIH.; The Human Immunodeficiency Virus (HIV) is one of the diseases with the highest morbidity and mortality in the world. The virological failure is the inability to maintain suppression of viral replication (HIV RNA <200 copies/mL) after 6 months of highly active antiretroviral therapy (HAART). The aim was to develop a prognostic model of virological failure in people living with HIV in Antioquia, Colombia. We conducted a historical cohort study. Included HIV patients of any sex over 13 years of age treated atthe IPS CIB Salud who received their first HAART regimen between July 1st2016, and December 31, 2019. For the development of the model, univariate and multivariate logistic regressions were used, and the model performance was determined by means of test calibration (Hosmer-Lemeshow), and the discrimination (area under the receiver operator curve -AUC). We included 211 HIV patients in the study, most of whom were male and had a median age of 27 years. Five prognostic models with similar performance were developed, AUC with discrimination between 0.9355 and 0.9471, and calibration with values close to 1.We recommend model four and five that included variables such as being an independent worker, adherence to HAART < 95 %, loss of more than one appointmentduring follow-up, viral load ≥ 50,000 copies/mL, and initial CD4+CD8 T cell ratio <0.5 were statistically associated with virologic failure. Investigating virological failure in HIV patients receiving HAART is essential to determine the current status of treatment and the factors associated with developing virological failure. Although the developed models have good calibration and discrimination, it is important to carry out an external validation study so that they can be used in the different HIV programs.
dc.description: Digital
2022-06-06T00:00:00Z