Examinando por Materia "Cambio estructural"

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    Descripción estructural de proteínas mutadas del sistema AcrAB de la bomba de eflujo en aislados clínicos de Escherichia coli con diferentes patrones fenotípicos frente a Quinolonas y Fluoroquinolonas
    (Bucaramanga : Universidad de Santander, 2019, 2019-11-29) Ramírez González, Yudith Marcela; Rincón León, Jacqueline; Farfán García, Ana Elvira; Trejos Suárez, Juanita
    La resistencia a los antibióticos es un problema de salud pública a nivel mundial, que ha aumentado exponencialmente con el paso de los años. La expresión de diversos mecanismos de resistencia en bacterias como E. coli, ha generado la disminución de la efectividad de antibióticos y el incremento de las estancias hospitalarias. Uno de los mecanismos de resistencia son las bombas de eflujo, que funcionan expulsando el antibiótico hacia el medio extracelular para evitar la muerte bacteriana. Objetivo: Describir los posibles cambios estructurales en las proteínas mutadas del sistema AcrAB de la bomba de eflujo de los aislados clínicos de E. coli mediante análisis bioinformáticos de proteínas. Metodología: En este estudio se utilizaron cepas de E. coli de aislados clínicos pediátricos con patrones de resistencia frente a Ciprofloxacina y Ácido nalidíxico. Se identificaron los genes acrA y acrB de la bomba de eflujo AcrAB-TolC mediante PCR simple y Electroforesis. De estos aislados se escogieron a conveniencia 9 productos amplificados para secuenciar para cada gen. Por último, se utilizaron herramientas bioinformáticas para analizar cambios estructurales en las proteínas de los aislados utilizados, con respecto a la proteína nativa de cada gen. Resultados: En 63 de los 66 aislados clínicos se identificaron los genes acrA y acrB, y se confirmó la presencia de estos con la secuenciación de 9 aislados escogidos a conveniencia para el gen acrA y acrB, respectivamente. A partir de las secuencias obtenidas, se determinaron las regiones conservadas y posibles zonas de mutación con los alineamientos de las secuencias de ADN. Al traducir dichas secuencias alineadas a proteínas, se evidenciaron los cambios de aminoácidos, los cuales fueron demostrados con la predicción de las posibles estructuras secundarias de las proteínas AcrA y AcrB de los aislados estudiados. Conclusiones: Se describieron los posibles cambios estructurales de las proteínas AcrA y AcrB de la bomba de eflujo AcrAB-TolC de los aislados clínicos de E. coli y la presencia de cambios notorios en los aminoácidos de 8 aislados.