Examinando por Autor "Ropero Vega, José Luis"
Mostrando 1 - 10 de 10
Resultados por página
Opciones de clasificación
- PublicaciónAcceso abiertoBiopolymeric pellets of polyvinyl alcohol and alginate for the encapsulation of Ib-M6 peptide and its antimicrobial activity against E. coli(Heliyon, 2019-05-29) Flórez Castillo, Johanna-Marcela; Ropero Vega, José Luis; Perullini, Mercedes; Jobbágy, Matias; CIBASThe encapsulation of Ib-M6 antibacterial peptide in pellets of polyvinyl alcohol (PVA) and polyvinyl alcoholalginate (PVA-Alg) matrices was carried out in order to explore its controlled release and activity against Escherichia coli K-12. The pellets were obtained by combined ice segregation induced self-assembly (ISISA) and freezing-thawing methods and their microstructure was studied by scanning electron microscopy. Bromothymol blue was used as a model compound to study the transport mechanisms and release from pellets. The results show that there is a significant effect of the total concentration of PVA precursor solutions, the mass ratio of PVA of different molecular weights and the addition of alginate on the microstructure and transport properties of pellets. The antibacterial activity of Ib-M6 against Escherichia coli K-12 was not affected by the encapsulation in PVA pellets. However, the release of Ib-M6 from PVA-Alg pellets was not possible, probably due to the electrostatic interaction of positively charged Ib-M6 and negatively alginate structure. Nonetheless, the controlled release of Ib-M6 from polymeric matrices can be fitting by modifying parameters such as the concentration and type of polymer precursors.
- PublicaciónAcceso abiertoEncapsulación de un Consorcio Microbiano con Actividad Promotora de Crecimiento Vegetal (PGPM) en una Matriz de Almidón de Yuca y Alginato(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2021, 2021-01-27) Amador Lamus, Ingrid Sofia; Acevedo Isidro, Carlos-Augusto; Agualimpia Valderrama, Bayron-Enrique; Ropero Vega, José Luis; Osorio Márquez, Jorge-DanielEl uso de microorganismos promotores de crecimiento vegetal (PGPM) son la alternativa actual para mejorar la producción agrícola. De esta manera, El objetivo de este trabajo de investigación fue evaluar la encapsulación de un consorcio microbiano con actividad PGPM a partir de alginato y almidón de yuca. Para tal fin, se realizó la encapsulación de las bacterias TSEBT 01-01, TSEBT 05-01 y el hongo TSPHP 04-01 utilizando como material de soporte el alginato a una concentración de 1% y el almidón de yuca variando su concentración ente 5 y 15%. Posteriormente, se realizaron pruebas de forma, tamaño y peso para establecer qué relación de alginato y almidón de yuca les confería uniformidad a las perlas. Para establecer la cantidad de microorganismos viables dentro de las perlas se realizó un conteo directo en cámara de Neubauer. Finalmente, se sometieron los microorganismos encapsulados a luz UV durante 60 segundos para establecer si su morfología macroscópica y su actividad PGPM se veía afectada por la radiación. Se encontró que la bacteria TSEBT 01-01 mantenía su actividad fijadora de nitrógeno y el hongo TSPHP 04-01 su actividad solubilizadora de fosfato. De acuerdo con lo anterior, se concluye que, el almidón de yuca a cualquier concentración permite la formación de estructuras con el alginato, donde a una concentración de almidón de 15% no se evidencian cambios de forma o tamaño mostrándose como una alternativa de protección para los microorganismos evaluados.
- PublicaciónAcceso abiertoEnhanced visible light photoelectrochemical performance of β-Bi2O3-TiO2/ITO thin films prepared by aqueous sol-gel(Springer-Verlag GmbH Germany, Journal of Solid State Electrochemistry, 2019, 2019-06) Ropero Vega, José Luis; Candal, Roberto J.; Pedraza Avella, J. A.; Niño Gómez, M. E.; Bilmes, Sara A.Semiconductor heterojunction of β-Bi2O3-TiO2/ITO thin films was prepared by aqueous sol-gel and their photoelectrochemical and photoelectrocatalytic properties were evaluated on the oxidation of salicylic acid. The β-Bi2O3 sol precursor properties were characterized by DLS, SEM, and X-ray diffraction. The composition and morphology of the films were characterized by SEM-EDS. The photoelectrochemical characterization was performed by linear sweep voltammetry with chopped light irradiation and photocurrent measurements. The photoelectrocatalytic activity of the films under UV-Vis and visible light irradiation was conducted on the oxidation of salicylic acid. Results show that the films are composed of a TiO2 layer with Bi2O3 particles dispersed throughout the surface. X-ray diffraction results confirm that the Bi2O3 obtained from the sol precursor prepared corresponds to β-tetragonal phase. The linear sweep voltammetry shows that the β-Bi2O3-TiO2/ITO films have a higher photocurrent in the anodic region than TiO2/ITO films used as reference. The photoelectrocatalytic activity of the β-Bi2O3-TiO2/ITO films on the oxidation of salicylic acid under visible light irradiation was higher than TiO2/ITO films. The results show that the β-Bi2O3-TiO2/ITO films are active under visible light and can be used in photoelectrochemical cells.
- PublicaciónAcceso abiertoEvaluación de Péptidos Análogos a la Proteína Tir Como Moléculas de Reconocimiento en Biosensores Electroquímicos para la Detección de Escherichia Coli O157:H7 en Matrices Acuosas(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2021, 2021-07-15) Redondo Ortega, Joshua Hugo Felipe; Ropero Vega, José Luis; Flórez Castillo, Johanna-Marcela; Rondón Villarreal, PaolaLos biosensores son sistemas basados en nanomateriales y biomoléculas que exhiben notables propiedades, tales como: simplicidad, portabilidad, eficiencia y facilidad de usar para la detección de patógenos como Escherichia coli. En este trabajo se informa por primera vez sobre el diseño de nuevos péptidos basados en la proteína TIR, un receptor de la proteína de membrana intimina característica de E. coli. Estos nuevos péptidos se utilizaron como elementos de reconocimiento para la detección de E. coli. Para este estudio, utilizando la herramienta LigPlot, se realizó un análisis de interacción entre intimina y TIR utilizando la estructura PDB: 2ZQK. Posteriormente, la secuencia asociada a la zona de interacción de TIR fue modelada con PEP-FOLD. Finalmente, a partir de los modelos obtenidos se realizó un estudio de Docking molecular y análisis de interacción, que permitieron definir dos moléculas de reconocimiento denominadas PEPTIR 1 y PEPTIR 2.0, las cuales fueron inmovilizadas en un transductor electroquímico basado en nanomateriales y se evaluó su capacidad de detección de E. coli mediante técnicas electroquímicas. El biosensor basado en PEPTIR 1.0 mostró la capacidad de detectar E. coli, exhibiendo un rango de trabajo lineal entre 0 a 500 UFC / mL y límites de detección y cuantificación de 2 y 6 UFC / mL, respectivamente. Además, el dispositivo mostró la capacidad de detectar de manera selectiva E. coli en presencia de otros microorganismos como P. aeruginosa y S. aereus. Por lo que se destacan la posibilidad de que este dispositivo pueda ser utilizado en la detección rápida, sensible y selectiva de E coli en matrices acuosas. Mientras que el biosensor basado en PEPTIR 2.0 mostró un gran potencial para ser evaluado en su capacidad para detectar con un mayor espectro, microorganismos gramnegativos en una matriz acuosa.
- PublicaciónAcceso abiertoEvaluación del Aptámero Diseñado “in silico” para la Detección Electroquímica de Escherichia coli O157:H7 en Matrices Acuosas(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2020, 2020-12-17) León Sánchez, Wendy Rocío; Ropero Vega, José Luis; Valdivieso Quintero, Wilfredo; Flórez Castillo, Johanna-MarcelaEscherichia coli enterohemorrágica (O157:H7) es un microorganismo Gram negativo y uno de los patógenos más importantes para el ser humano. Su principal mecanismo de patogenicidad es la expresión de la toxina shiga, ya que ocasiona graves daños al epitelio intestinal. Actualmente existen diversos mecanismos para la detección de este microorganismo; entre ellos está la filtración por membrana y la cuantificación molecular. Sin embargo, cada una de estas técnicas tiene limitaciones como el tiempo que se requiere para obtener algún resultado, la capacitación que del personal y los altos costos del equipamiento. Por lo anterior surge la necesidad de nuevos métodos que permitan la detección rápida y sensible de este microorganismo. Por lo cual, en este trabajo se desarrolló de un aptasensor electroquímico cuya molécula de reconocimiento consiste en un aptámero diseñado “in silico” que permite la detección de Escherichia coli en matrices acuosas. Para esto se realizó una revisión bibliográfica sobre artículos científicos, que trataran de aptasensores diseñados para la detección de Escherichia coli y a partir de ellos se construyó una base de datos con la información más importante de cada uno. Todos estos datos se analizaron y a partir de las mejores secuencias se inició la construcción, agregando fragmentos necesarios para que fuera un aptámero “in silico” completamente funcional. El aptámero diseñado fue inmovilizado sobre electrodos serigrafiados modificados con nanopartículas de oro y la detección electroquímica se realizó a través de EIS (Espectroscopía de impedancia electroquímica), CV (Voltametría cíclica) y SWV (Voltametría de onda cuadrada). De los cuales se obtuvo que los electrodos que mostraron mejor comportamiento fueron el 1 y 2 por lo que se podría concluir que la electrodeposición de oro a +0.05mV beneficia la detección de Escherichia coli O157:H7, además es importante mencionar que el método “in silico” puede ser una gran alternativa para diseñar y obtener aptámeros.
- PublicaciónAcceso abiertoIb-M6 Antimicrobial Peptide(Basilea : MDPI, 2020, 2020-02-12) Flórez Castillo, Johanna-Marcela; Rondón Villarreal, Paola; Ropero Vega, José Luis; Mendoza Espinel, Stephany Y.; Moreno Amézquita, July A.; Méndez Jaimes, Karen D.; Farfán García, Ana Elvira; Gómez Rangel, Sergio-Yebrail; Gómez-Duarte, Oscar G.; Universidad de SantanderEl péptido Ib-M6 tiene actividad antibacteriana contra la cepa K-12 de Escherichia coli no patógena . La primera parte de este estudio determina la actividad antibacteriana de Ib-M6 contra catorce cepas patógenas de E. coli O157: H7. El ensayo de susceptibilidad mostró que Ib-M6 tenía valores de Concentración Inhibitoria Mínima (MIC) más bajos que la estreptomicina, usada como antibiótico de referencia. Además, para predecir la posible interacción entre Ib-M6 y los componentes de la membrana externa de E. coli, utilizamos simulaciones de acoplamiento molecular donde la proteína FhuA y su complejo con Lipopolisacárido (LPS-FhuA) se utilizaron como objetivos del péptido. Los complejos FhuA / Ib-M6 tenían valores de energía entre -39,5 y -40,5 unidades de energía Rosetta (REU) y solo un enlace de hidrógeno. En contraste, los complejos entre LPS-FhuA e Ib-M6 mostraron valores de energía entre -25,6 y -40,6 REU, y la presencia de cinco posibles enlaces de hidrógeno. Por tanto, la actividad antimicrobiana del péptido Ib-M6 mostrada en los ensayos experimentales podría deberse a su interacción con la membrana externa de E. coli .
- PublicaciónAcceso abiertoIb-M6 antimicrobial peptide: Antibacterial activity against clinical isolates of Escherichia coli and molecular docking(2020-03-12) Flórez Castillo, Johanna-Marcela; Rondón Villarreal, Paola; Ropero Vega, José Luis; Mendoza Espinel, Stephany Y.; Moreno Amézquita, July A.; Méndez Jaimes, Karen D.; Farfán García, Ana Elvira; Gómez Rangel, Sergio-Yebrail; Gómez Duarte, Oscar Gilberto; CLINIUDES; CIBASThe Ib-M6 peptide has antibacterial activity against non-pathogenic Escherichia coli K-12 strain. The first part of this study determines the antibacterial activity of Ib-M6 against fourteen pathogenic strains of E. coli O157:H7. Susceptibility assay showed that Ib-M6 had values of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) lower than streptomycin, used as a reference antibiotic. Moreover, to predict the possible interaction between Ib-M6 and outer membrane components of E. coli, we used molecular docking simulations where FhuA protein and its complex with Lipopolysaccharide (LPS–FhuA) were used as targets of the peptide. FhuA/Ib-M6 complexes had energy values between −39.5 and −40.5 Rosetta Energy Units (REU) and only one hydrogen bond. In contrast, complexes between LPS–FhuA and Ib-M6 displayed energy values between −25.6 and −40.6 REU, and the presence of five possible hydrogen bonds. Hence, the antimicrobial activity of Ib-M6 peptide shown in the experimental assays could be caused by its interaction with the outer membrane of E. coli. View Full-Text
- PublicaciónAcceso abiertoImmobilization of Ib-M2 peptide on core@shell nanostructures based on SPION nanoparticles and their antibacterial activity against Escherichia coli O157:H7(Applied Surface Science, 2020-03-16) Ropero Vega, José Luis; Ardila Rosas, N.; Hernández Peñaranda, Indira Paola; Flórez Castillo, Johanna-Marcela; CLINIUDES; CIBASAntimicrobial peptides arise as a very promising alternative for the treatment of infections generated by pathogenic microorganisms. The Ib-M2 antimicrobial peptide turns out to be a very promising candidate for these types of applications. However, it is required to evaluate immobilization systems that give peptides greater stability and activity in order to be used in biological systems. Given the above, this paper reports the preparation of superparamagnetic iron oxide nanoparticles (SPIONs) coated with chitosan in order to immobilize the Ib-M2 antimicrobial peptide. Structural properties of SPIONs were studied by DLS, SEM, XRD, FT-IR, XPS and the magnetic properties were evaluated by vibrating-sample magnetometer technique. The antimicrobial activity of the Ib-M2/SPIONs@Chi bioconjugate obtained was evaluated against Escherichia coli O157:H7 by determining the minimum inhibitory concentration (MIC). Results show that the SPIONs obtained have particle size between 10 and 15 nm with a magnetite-type structure which was confirmed by FT-IR and XPS. Characterization of magnetic properties evidences a superparamagnetic behavior of nanoparticles obtained. MIC results showed that Ib-M2/SPIONs@Chi bioconjugate exhibit a comparable or higher activity against E. coli in comparison with the free Ib-M2 peptide. These results show that the bioconjugate obtained can be considered for use in biomedical applications.
- PublicaciónAcceso abiertoInmovilización de Estreptomicina en Micropartículas de Alginato-Chitosan para la Inhibición de E. coli O157:H7(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2021, 2021-06-30) Guarín-Villarreal, Carol Julieth; Flórez Castillo, Johanna-Marcela; Ropero Vega, José LuisActualmente, la encapsulación es un método de gran importancia científica debido a las ventajas que estas poseen. En la industria farmacéutica, se ha encontrado la forma de controlar la dosificación de los antibióticos usando esta metodología para proteger los sistemas bioactivos, y manejar el tiempo de entrega y concentración de este. El Alginato y el Chitosan, son algunos de los biopolímeros de mayor uso para esta metodología, gracias a que no son tóxicos, y se puede dosificar repetidas veces sin ocasionar efectos adversos. En el caso de E. coli O157:H7, es un microorganismo de gran importancia, ya que causa grandes cifras de morbimortalidad al año, y no existe tratamiento específico para este. La estreptomicina, es un antibiótico que se ha usado en algunos cuadros para E. coli O157:H7, por lo que el objetivo de este proyecto es la inmovilización de estreptomicina en micropartículas poliméricas de Alginato-Chitosan para la inhibición de E. coli O157:H7. Se probaron distintas formulaciones de micropartículas, alterando la concentración de Alginato y CaCO3. Se utilizó SEM para la visualización de las micropartículas formuladas y se probó su actividad antimicrobiana mediante la técnica de microdilución. Se obtuvo un tamaño promedio de 0.5-5 μm de las micropartículas y se logró una CMI de 12.5μM de estreptomicina contra E. coli O157:H7, con la estreptomicina inmovilizada en las micropartículas. No se encontró actividad antimicrobiana por parte de las micropartículas de Alginato-Chitosan, por lo que la actividad de inhibición se le atribuye a la estreptomicina inmovilizada.
- PublicaciónAcceso abiertoModificación de electrodos impresos con nanopartículas de oro y péptidos PEPTIR para la detección de Escherichia coli en matrices acuosas(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2020, 2020-12-17) Galvis Curubo, Yuly Juliana; Ropero Vega, José Luis; Flórez Castillo, Johanna-MarcelaEl diseño de biosensores electroquímicos basados en electrodos serigrafiados (SPEs) ha demostrado su aplicabilidad en una serie de áreas relacionadas con la salud pública, que requieren el desarrollo de técnicas y dispositivos para la detección de microorganismos patógenos debido a su simplicidad y alta sensibilidad. Por consiguiente, se desarrolló un biosensor electroquímico para la detección analítica rápida de Escherichia coli mediante la modificación de un electrodo serigrafiado (SPE) con nanopartículas de oro y péptidos PEPTIR como elemento biológico de reconocimiento. En este estudio se analizó la influencia de diferentes parámetros experimentales como la síntesis de nanopartículas, inmovilización del péptido y concentración de E. coli en la respuesta del biosensor para mejorar la respuesta. Para el diseño del biosensor, se utilizaron péptidos diseñados en el grupo de investigación CIBAS; PEPTIR 1,0 CQKVNIDELGNAIPSGVLKDD y PEPTIR 2,0 CQKVNIAELGNAIPSGVLKDD. El péptido 1 corresponde a un péptido análogo a la proteína TIR (Translocated Intimin Receptoren) y el péptido 2,0 corresponde a un péptido análogo a la proteína TIR modificado con el cambio de una Asparagina por una Alanina. Se encontró que los electrodos modificados con AuNPs a potencial de reducción de -0,05 V por 100 s favorecía el proceso de síntesis de nanopartículas sobre la superficie del electrodo. Por su parte, cuando se utilizó una concentración baja de péptido (100 nM) para la inmovilización se presentaron los mejores resultados en la detección de E. coli. Cuando se utilizó PEPTIR 1,0 para la modificación de los electrodos se presentó una tendencia lineal en la curva de cuantificación en un rango de concentración de E. coli entre 10 y 250 UFC/mL, que indica que la concentración de la bacteria es directamente proporcional al ΔINormalizado obtenido de la señal del sensor. Este trabajo demuestra que los electrodos modificados con nanopartículas de oro y péptidos PEPTIR como elemento de reconocimiento molecular en la detección de bacterias es una plataforma prometedora para el desarrollo de biosensores electroquímicos.